多组学测序 多组学测序 多组学是指将多个单一的组学(如蛋白质组、代谢组、转录组和脂质组等)分析数据进行全面系统的整合分析以发掘不同物质在动态生命活动中的相互作用关系等的科学,多组学整合分析突破了单一组学分析存在的瓶颈。多组学测序就是同时进行多个组学层面的测序分析,如蛋白质组、微生物组、转录组和代谢...
测序中的GC偏好指的是基因组上GC含量在50%左右的区域更容易被测到,产生的reads更多,这些区域的覆盖度更高,在高GC或者低GC区域,不容易被测到,产生较少的reads,这些区域的覆盖度更少。用基因组单位长度的bin中…
研究人员基于同济医院肾细胞癌(TJ-RCC)队列的100例ccRCC患者样本和50例配对的正常邻近组织(NATs)采用了多组学技术,对ccRCC样本进行全面分析(图1a), 通过基因组、转录组、蛋白质组以及代谢组等多层面的综合分析,构建ccRCC免疫亚型,深入探索ccRCC的代谢重编程现象及其分子机制,识别潜在的治疗靶点及生物标志物,为个性化治...
⏩整合测序数据并关联分析:借助 genesorteR R 包整合 bulk-seq 与 scRNA-seq 数据,剖析实验组和对照组的转录差异,并探究其与肿瘤样本 bulk-seq 生存率的相关性。 ⏩分析特征基因与生存关系:分析细胞亚群特征基因在亚群及样本中的表达差异,明确其与病人生存率的关联,发现抗炎特征表达与生存率的联系,且 CIBERSORT...
▲ 镁景科技成立仪式现场揭牌当前,多组学测序在生命科学领域展现出广阔前景,但也面临多维数据整合效率低、标准化不足、分析一致性差等关键挑战,制约了其在临床应用和产业转化的发展。序祯达生物是中国多组学技术服务的开拓者,专注于构建全面的组学分析体系,在基因组测序、转录调控和单细胞分析等领域提供完整解决方案...
HiFi测序技术以其长读长、高准确性和多组学应用能力,正在成为基因组学研究的新标准。从基因组组装到复杂变异检测,从表观遗传学到转录组学,HiFi测序为我们提供了前所未有的研究工具。随着技术的不断发展,HiFi测序有望为人类健康和疾病研究带来更多的突破。参考文献:Wang B, Jia P, Gao S, et al. Long and...
同一细胞多组学测序 同一细胞多组学测序 同一细胞多组学测序能从多层面解析细胞特征。它整合多种组学数据助力细胞深入研究。转录组测序可揭示细胞中基因转录水平。蛋白质组测序能明确细胞内蛋白质种类 。代谢组测序可分析细胞代谢产物的情况。多组学结合可展现细胞更全面分子图谱。其有助于发现新的细胞标志物和靶点 。
1.什么是空间多组学测序技术 基于微流体条码标记的空间多组学测序技术(DBiT-seq技术)的原理是利用微流控芯片技术,对切片组织进行编码,通过在组织中使用确定性条形码进行空间组测序,从而实现在切片组织中共同绘制mRNA和蛋白质定位。据文章介绍,DBiT-seq不需要裂解组织即可释放mRNA,并且与现有的甲醛固定的组织玻片...
多组学测序技术的应用非常广泛。首先,在基因组学研究中,多组学测序可以用于全基因组测序、外显子测序和转录组测序等。全基因组测序可以帮助我们了解生物体的基因组结构和功能,有助于揭示基因与表型之间的关系。外显子测序可以用于鉴定致病基因和研究遗传疾病的发生机制。转录组测序可以帮助我们了解基因的表达模式和调控网...
(3)多组学策略揭示了 NSUN2 在卵巢癌中的靶点 为进一步探索NSUN2介导的基因表达调控,作者对NSUN2敲除的卵巢癌细胞进行RNA测序(RNA-seq),并对卵巢癌细胞进行RNA结合蛋白免疫沉淀测序(RIP-seq)。测序分析结果表明,在卵巢癌细胞中,NSUN2敲除导致1744个基因表达变化,RIP-seq显示NSUN2能够与2842个转录本结合。GO分...