这里使用R语言IOBR包对患者进行免疫浸润分析,其中包括CIBERSORT,mcpcounter,xcell,timer,quantiseq多种算法。 1、CIBERSORT是一种用于计算免疫细胞相对丰度的计算工具,可以通过分析基因表达数据估计复杂组织或血液样本中不同免疫细胞类型的相对丰度。 根据样本基因表达数据和参考基因签名,使用机器学习算法(如线性混合模型)来估...
多种算法在肿瘤免疫细胞浸润水平评估中的应用有哪些? R基础:生信分析的R语言基础教程都在这里了,包括语法,绘图和数据分析。 生物信息数据分析教程视频——01-TCGA数据库RNAseq数据下载与整理 生物信息数据分析教程视频——02-TCGA数据库miRNA数据下载与整理 生物信息数据分析教程视频——03-有关TCGA数据库临床数据的问...
TFRC在其他癌症中也被广泛研究。在生信研究中,TFRC这一类铁死亡相关基因是值得重点关注的。还可以借鉴作者采用多种算法分析肿瘤微环境中的免疫细胞浸润情况,以及单基因与免疫治疗的关系。 铁死亡与免疫一直是生信分析的两大热点,所以当这两点结合后,便可轻松的做出不错的成果。这篇文章思路清晰,可以当作铁死亡+免疫浸润...