在靶标结构未知的情况下,基于配体的虚拟筛选(Ligand-Based Virtual Screening, LBVS)变得尤为重要,其基本理念是相似属性原则,即相似结构的分子往往具有相似的性质。传统的LBVS方法通常涉及指纹相似性、形状相似性和基于药效团的匹配等技术,但通常需要预先生成多种配体构象以更好地模拟其灵活性。然而,这些方法在处理配体...
AutoDock-SS:基于多构象配体虚拟筛选的AutoDock 虚拟筛选(Virtual Screening, VS)在药物发现的早期阶段扮演着关键的角色,它利用计算技术对庞大的化合物库进行预先筛选,以发现可能具有生物活性的化合物。然而…
基于不同构象的InhA蛋白结构,结合两种不同的打分函数和类药性规则,筛选了Specs 数据库中约20万小分子,选出16个化合物进行活性测试,并获得了活性最好的化合物7与蛋白的晶体结构,结合模式显示化合物7不用于先前报道的抑制剂,有望成为新型的抗结核药物。基于结构的虚拟筛选流程 结核杆菌enoyl-酰基载体蛋白还原酶(...
在靶标结构未知的情况下,基于配体的虚拟筛选(Ligand-Based Virtual Screening, LBVS)变得尤为重要,其基本理念是相似属性原则,即相似结构的分子往往具有相似的性质。传统的LBVS方法通常涉及指纹相似性、形状相似性和基于药效团的匹配等技术,但通常需要预先生成多种配体构象以更好地模拟其灵活性。然而,这些方法在处理配体...