神经元分化早期,Olig蛋白启动子1~3特异性地与多个基因组区域相互作用;分化晚期时,更远的Olig蛋白启动子4开始加入互作。除较远的Olig蛋白启动子4之外,所有神经元的Olig蛋白启动子区域都有一个DHS和H2K27ac峰,而肌细胞无此现象。 Olig蛋白启动子1~3区域在部分细胞分化阶段里,具有与Olig蛋白基因表达重叠的增强子活性,...
当复合体追踪到启动子时,会拉动增强子与启动子的结合,形成“RNA Pol II-转录因子-增强子-启动子”复合物,参与转录调控。B: 增强子富集各类转录因子TF寡聚,这些复合体通过空间效应与启动子相链接,形成“Linking/Chaining”结构。C: 在细菌及λ噬菌体模型中,染色体DNA的超螺旋特定构象发生“Short-range Looping”,各类...
测试K562细胞中5920个候选增强子的功能,发现功能增强子-启动子对的标准化接触数量显著增加。此外,在相同的超级增强子中,与非功能成分相比,功能成分增强子与目标启动子的接触频率显著更高。即使在排除基因组距离、位点特异性调控效应、染色质可及性和...
已经有研究报道,在癌症中原癌基因如AR、FOXA1和MYC的高表达与启动子与超级增强子异常互作有关。为进一步确定超级增强子与启动子之间的互作关系,研究人员利用HiChIP-seq技术对H3K4me3(活跃启动子的marker)和H3K27Ac进行了分析,结果显示AU-153...
本研究表明:启动子的相互作用的特异性是依赖高度特定细胞分化类型的;并由激活的启动子和表观遗传特异性增强子直接特异互作情况在细胞分化过程中程度获得富集。 Promoter interactomes reflect lineage relationships of the hematopoietic tree, consistent with dynamic remodeling of nuclear architecture during differentiation...
增强子作为一种远端调控元件通过与启动子发生相互作用,调控基因的表达.对于增强子和启动子的相互作用,有研究显示与转录因子活性以及核苷酸序列相关.但是,增强子和启动子之间相似的核苷酸序列在二者互作中所起到的具体生物学功能尚不明确. 为了探究增强子和启动子间相似核苷酸序列在二者互作中发挥的功能,我们利用生物信息学中...
超级增强子鉴定服务 超级增强子 (Super Enhancer, SE) 为8 ~ 20 kb 具有转录增强活性的超长顺式作用元件,可富集高密度的关键转录因子(master transcription factors)、辅因子(cofactor)和增强子表观修饰标记(histone modification marks) 更多 CUT & RUN 技术服务 ...
总之,在这项研究中,作者基于PROTAC技术开发了染色质重塑复合物SWI/SNF的蛋白降解剂AU-15330,该降解剂一方面可以通过破坏染色质构象即超级增强子—启动子互作降低原癌基因诸如AR的表达,另一方面可以改变AR等原癌基因结合位点的染色质可及性调控其下游基因的表达(下图)。同时,研究人员还证明了AU-15330在AR+FOXA1前列腺...
总之,在这项研究中,作者基于PROTAC技术开发了染色质重塑复合物SWI/SNF的蛋白降解剂AU-15330,该降解剂一方面可以通过破坏染色质构象即超级增强子—启动子互作降低原癌基因诸如AR的表达,另一方面可以改变AR等原癌基因结合位点的染色质可及性调控其下游基因的表达(下图)。同时,研究人员还证明了AU-15330在AR+FOXA1前列腺...
超级增强子鉴定服务 超级增强子 (Super Enhancer, SE) 为8 ~ 20 kb 具有转录增强活性的超长顺式作用元件,可富集高密度的关键转录因子(master transcription factors)、辅因子(cofactor)和增强子表观修饰标记(histone modification marks) 更多 CUT & RUN 技术服务 ...