这回正好身边的人会做,就问了一个作者,结果回复是origin画的,有个选项就可以添加组间连线。 现在方法是有了,不过我还是喜欢用R来画图,因为每一个细节的修改都落实的代码上,可见可重复。 而窗口操作类的软件,操作过程是不容易被记录的,别人也很难重复。 我下午将此问题放在了宏基因组0讨论群中,问是否有R包...
然而当分类较多时,堆叠柱状图看起来不是那么清晰,通过添加额外的连线,可以增加堆叠柱状图的颜值,给人一种连贯的感觉,并且能够更好地观察数据比例的变化。 图1. 堆叠柱状图(带填充) 如图1所示,这里展示了5个样品的m6A甲基化peak在不同基因组特征上的分布比例,相同类型的基因组特征使用浅色带连接,连贯且有一种伪3D的...
籼粳稻间微生物组差异在门水平也存在显著差异(图1f)。在两块地中,籼、粳稻间根系微生物组相比,籼稻更富集δ-变形菌纲(Deltaproteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、产酸菌门(Acidobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、螺旋体门(Spirochaetes)、绿弯菌门(Chloroflexi)、 Ignavibacteriae、硝化螺旋菌门(Nitrospirae...
即然有了画两组的模板,仔细读一读代码,改成三组的应该不难,代码如下: # 画三个组间比较library(reshape2) # 读生一个测试数据宽表格df=data.frame( Phylum=c('Ruminococcaceae','Bacteroidaceae','Eubacteriaceae','Lachnospiraceae','Porphyromonadaceae'), GroupA=c(37.7397,31.34317,222.08827,5.08956...
使用户能够快速创建各种常见的统计图形,如线图、散点图、柱状图、箱线图、直方图、小提琴图、QQ图、核密度图、热力图和配对图等。...ggpubr支持处理多组数据、分组、堆叠、分面、添加回归线、椭圆、置信区间、自定义标记等功能,可以满足各种不同的数据展示需求。...ggscatter():创建散点图,用于展示两个连续...
堆叠柱状图连线画法 提出问题 宏基因组之前转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图,添加组间各成分连线,可以更容易的观察和比较组间的变化。如下图: 我在很多文章中也见过,一直没有学会具体的做法。这回正好身边的人会做,就问了一个作者...
例3. 堆叠柱状图+组间连线 本文于2020年7月7日由南京农业大学资源与环境科学学院沈其荣团队发表于The ISME Journal, [IF 9.49]。-《ISME:南农沈其荣团队基于大数据准确预测土壤的枯萎病发生》。在这里,我们选择了文章中图1C为例进行讲解。这里堆叠柱状图每个微生物门类之间都通过曲线连接,这在有限的微生物堆叠柱状图...