Omicsmart平台在满足loupe cell browser功能的同时,可兼容cell ranger、seurat数据;使用者自己调试合理的细胞过滤条件;图形参数可调性高,可达到发表文章水准;基因列表包含原始表达量信息和GO注释、KEGG注释。 此次平台上线针对解决10X单细胞转录组的三大基础问题:1、低质量细胞如何界定;2、细胞亚群鉴定;3、亚群上调基因分析。
为方便在基迪奥生物完成测序和分析的客户能够享受更为便利、友好的数据挖掘服务,基迪奥生物最新推出Omicsmart动态在线分析系统。Omicsmart根据每个用户的测序数据量身定制,以动态报告的方式呈现,操作简单,分析内丰富,数据安全性高,力求使生信分析更为动态化、定制化、人性化。 现阶段,Omicsmart动态在线分析系统拥有转录组数据...
4. STEM趋势分析常见问题与解决 5. 利用omicshare/omicsmart平台完成STEM趋势分析 STEM软件本身是为windows系统开发的软件,用户使用该软件进行分析较为低效。基迪奥通过自主开发,通过重写软件将STEM整合到linux系统中,并与基因功能GO/KEGG富集分析整合在一起,从而开发出在线版的STEM分析工具,可以大大提高用户进行STEM分析的...
Smart-seq2 单细胞转录组测序通过 SMART 扩增技术对单个细胞中的 mRNA 进行逆转录和 PCR 扩增,结合转座酶建库技术,最终使用高通量测序手段,对单细胞中 mRNA 进行基因表达定量、功能富集、代谢通路等分析。它可以解决传统 RNA 定量技术在早期胚胎发育、干细胞、癌症、免疫等研究领域中存在的样品量极低或细胞异质性的...
基迪奥生信视频在线课程OmicShare Class,专注于提供专业、实用的生信教程。包含丰富的生信工具教程、生信软件教程,以及单细胞测序、转录组测序、翻译组测序、微生物测序等丰富的生信培训视频课程。
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基迪奥论坛 OmicShare Forum是一个专注于生物信息技术、组学 分享的高通量测序专业论坛。为科研人员提供专业的生物信息交流、生信共享云平台。
omicsmart.com是广州基迪奥生物科技有限公司旗下网站,网站成立于2017年12月6日。网站主要内容为:组学共享,omicshare,omicshare forum,omicshare tools,生物信息学习,基迪奥论坛,基迪奥云平台,基迪奥工具网站,基迪奥omicshare等。网站前端技术使用swiper,jquery,bootstrap,网站后端技术使用apache http server。网站已经通过工信部备...
1.功能富集分析的原理 2.功能富集分析结果的图形展示方式 3.功能富集分析常见问题与解决 4.利用omicshare平台获得动态富集报告 直播地址: Omicsmart转录组用户群(QQ群:867486887) Tips: 对转录组感兴趣的老师和同学可留言咨询,基迪奥会为您量身定制专业的个性化实验分析方案。
2 数据探索 2.1 预测软件选择 2.2 个性化图形展示 2.3 高效差异分析 3 经验总结 直播地址: Omicsmart微生物用户群(QQ群:779028977) 扫描图中二维码加入QQ群 。我们将在明天(周四)下午4点以群视频的方式进行直播和在线互动。我们期待和你一起学习交流进步!