ids,by.x="probe_id",by.y="probe_id")# 合并数据exp2=exp2[!duplicated(exp2$symbol),]# 按照symbol列去重# 数据框probe_exp的行名变成symbolrownames(exp2)=exp2$symbol
同时检索多个基因id时可以直接从excel中粘贴下来,格式如下图: 还有一种更方便快捷的方法就是直接点击dbFind,选择输出基因ID类型,ID list处输入基因名。 02 DAVID数据库 1.登陆网址:https://david.ncifcrf.gov/,依次点击如下: 2.选择基因ID转换: 3.选择转换后的基因名类型、填写物种信息: 4.提交后得到结果: ...
5167 1 0:54 App 二: 基因id一键转换 856 -- 11:30 App 9脚本使用,基因名换成基因id 22.1万 239 9:48 App 中药复方网络药理学:2.1 TCMSP的使用(一) 3030 -- 2:13 App 蛋白数据库uniprot Retrieve ID mapping intro 6750 1 5:33 App 网络药理学 Part2--成分靶点数据的处理(SWISS、Pharmapper...
使用蛋白ID进行GO/KEGG富集分析和将蛋白ID转化为基因ID进行分析可能会得到相似的结果,但还是有些许差异: (1)UniProt主要关注单个蛋白质的详细注释,而GO/KEGG富集分析关注的是基因或蛋白质列表中的整体功能趋势或富集模式。 (2)当你需要了解单个蛋白质的信息时可以使用UniProt,而当你想了解一组蛋白质或基因在整体上可...
第一步首先将待转化的基因ID列表复制粘贴到step1表格中,GO分析和KEGG基因ID列表一般为单列,而后面步骤转化每个基因ID时都需要每个基因ID单独占一个单元格。因此,第一步我们需要将单列的基因ID进行分列处理。 选中该列数据,在上方菜单栏中找到【数据】,【分列】→【分隔符号】→【分号】(根据实际情况选择)→【完成...
基因id转换为基因名R语言,基因id转换为基因名是基因组学研究中常见的任务之一。在生物学研究中,基因id通常以一系列数字或字母的组合形式表示,这使得基因的理解和分析变得困难。因此,将基因id转换为基因名可以更好地帮助研究人员理解和解释基因功能、相互作用等。在R语言
利用R语言进行TCGA基因ID转换的实用指南 引言 癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)是一个广泛应用于癌症研究的公共数据库,包含大量关于基因变异、表达和临床信息的数据。TCGA中的基因ID通常采用不同于其他数据库的命名方式,因此在分析和整合数据时,我们需要将TCGA基因ID转换为其他常用基因ID(如Ensembl ID或...
很抱歉，目前无法直接将Glyma大豆基因号转化为ensemble id。但是，可以通过以下步骤将Glyma大豆基因号转化为ensemble id：在NCBI网站上搜索Glyma大豆基因号，并找到相应的ENSEMBL id。例如，对于Glyma.15G135200基因，可以搜索“Glyma.15G135200”或“Glyma15G135200”，并找到相应的ENSEMBL id。在ENSEMBL网站上...
本文以批量转化Uniprot ID为基因名的步骤为主线，引导读者完成操作，提升科研效率。首先，请访问uniprot.org/并点击页面顶部的“Retrieve”选项，进入数据检索页面。在检索页面中，找到并点击“IDmapping”选项，跳转至ID映射页面。在ID映射页面上，输入您需要转化的Uniprot ID。请确保每个ID之间用逗号分隔，以...
其具体步骤包括:将GoGID基因插入到载体质粒DNA中;将插入有GoGID基因的载体导入到根癌农杆菌LBA4404中;农杆菌的培养;紫花苜蓿外植体的准备及转化;紫花苜蓿转基因植株鉴定、扩繁及评价。东方山羊豆赤霉素受体基因GoGID在紫花苜蓿中超表达后,转基因紫花苜蓿的株高增加了0.2‑0.35倍,生物量增加了14.9‑46.3%,紫花...