本文首先将介绍差异基因表达的 z score 以及其在差异基因表达研究中的应用。然后,我们将详细解释 z score 的含义,并探讨它在差异基因分析中的作用。接着,我们将对 z score 进行与其他指标的比较和评估。随后,通过实例分析和应用案例,我们将展示 z score 在不同研究领域中的应用情况,并提出在实际应用中需要注意的...
大体而言,目前求算组织特异性的计算方法主要分为两大类:一类是计算基因是否具有组织特异性(如tau,gini,tsi,countsandhg),不区分该基因在不同组织中的特异性程度;另一类算法则分别计算基因在每一类组织中的特异性程度(z-score,spm,eeandpem)。每类方法在特定的应用场景都具有特定的优势,最近有一项研究分析和比较了...
单细胞36计之30- 基于FPKM标准化表达矩阵做单细胞差异分析 30、第三十计 反客为主本是客人却用主人的口气说话。后指在一定的场合下采取主动措施,以声势压倒别人。 代码框较乱,... Seurat_Satija阅读 2,111评论 0赞 7 转录组分析实战第五节:EdgeR对表达量矩阵进行基因表达差异分析 通过前期的基因定量,我们通过R...
(74)专利代理机构广州粤高专利商标代理有限公司 代理人林丽明 (51)Int.CI 权利要求说明书说明书幅图 (54)发明名称 一种用于计算基因的组织特异表达的鲁棒z-score打分方法 (57)摘要 本发明提供了一种用于计算基因的组织特 异表达的鲁棒z‑score打分方法,该方法对基因 的组织特异表达有更高的敏感度,且能够直接...
一种用于计算基因的组织特异表达的鲁棒z-score打分方法专利信息由爱企查专利频道提供,一种用于计算基因的组织特异表达的鲁棒z-score打分方法说明:本发明提供了一种用于计算基因的组织特异表达的鲁棒z‑score打分方法,该方法对基因的组织特异...专利查询请上爱企查
计算鲁棒z-score: S8.利用鲁棒z-score计算组织特异表达值的统计显著性pi值: 其中,Φx是标准正态分布的分布函数;S9.设定一个阈值,若pi小于设定的阈值,则拒绝零假设,认为该基因或细胞型在序号为i的组织上有特异表达;如果pi大于或等于设定的阈值,则接受零假设,认为该基因或细胞型在序号为i的组织上没有特异表达。
本发明提供了一种用于计算基因的组织特异表达的鲁棒z‑score打分方法,该方法对基因的组织特异表达有更高的敏感度,且能够直接评估统计显著性的特点,解决了现有技术的缺陷。 法律状态 序号法律状态公告日法律状态法律状态信息 1 2021-07-13 授权 授权 2 2019-02-19 实质审查的生效 实质审查的生效IPC(主分类):G...