随着测序技术的发展,单一组学的分析往往不能很好地解释生物学问题,此时多组学的联合分析应运而生。在疾病研究领域,可能涉及到组学数据有,基因组,外显子组,转录组,表观组,蛋白组或代谢组等。通过不同组学的…
如果一个基因有编码区的非同义突变,同时转录组又鉴定到这个基因的表达在肿瘤组织和正常组织中存在差异,那么这个基因与疾病的关系就会被描述的很清楚,基因的突变影响了基因的表达,从而造成相关信号通路的异常,进而对疾病造成影响。除此之外,通过全基因组重测序或者外显子组鉴定出来的拷贝数异常(CNV)和染色体结构变异(SV...
此外,对28例原发肿瘤组织进行了转录组测序(RNA-seq),对2例患者(包括2例原发肿瘤、4例局部淋巴结肿瘤和5例远处转移肿瘤)的11个样本进行了单细胞转录组测序,以在细胞分辨率水平上探索鼻咽癌转移的进化途径(图1b)。 基于全外显子组/全基因组测序数据,利用MutSigCV分别鉴定原发、局部淋巴结和远处转移性肿瘤中的显...
为了确认菌株完整性,全基因组测序也显示进化菌株中突变较少。突变在转录组中变化显著,涉及膜转运、氨基酸代谢、糖摄取和细胞壁合成等基因表达水平发生了显著改变。分析导致异丁醇耐受复杂表型的这些变化的协同效应,有助于构建更好的异丁醇生产宿主平台。 论文ID 原名:Genomics and transcriptomics analysis reveals the mec...
日本比目鱼的基因组和转录组联合分析其不对称结构 摘要: 鲽鱼是身体结构不对称的脊椎动物。在变态发育期间,一只眼睛迁移到颅骨的对侧,同时颅面发生转变,色素沉积也倾向一侧。这种生理的演变过程依然神秘。 本文比对分析两种鲽鱼的基因组和转录组,发现甲状腺激素、视黄...
探究非编码区域突变对调控元件和信号通路的影响；最后，通过对所有变异基因的信号通路分析，揭示其潜在机制。进行基因组和转录组联合分析时，建议至少取样10对，样本组织大小要大以保证DNA和RNA的充足。我们已具备相关案例和分析经验，老师如需咨询，请与当地销售联系。未来，我们还将推出更多组学的联合分析...
整合基因组学和转录组学数据,DNA层面筛选的候选基因在转录水平的展示,RNA层面显著差异表达基因在基因组突变的分析,以及关键基因的通路富集分析等,将基因组和转录组紧密的联系起来。常见思路如下图: 推荐的文章:基因组学与转录组学联合分析揭示网状色素异常的致病机理...
单一组学已很难满足科研需求,随着测序技术的普及和分析方法的完善,多组学联合的方法逐渐成为主流,疾病研究也呈现出多组学发展的趋势,在研究疾病致病机理、筛选治病靶点的研究中发挥重要作用。整合基因组学和转录组学数据,DNA层面筛选的候选基因在转录水平的展示,RNA层面显著差异表达基因在基因组突变的分析,以及关键基因的...
基因较少等突出问题,以肉质性状和肌间脂肪沉积能力存在显著差异的日本和牛与草原红牛为研究对象,采用全基因组DNA甲基化测序(WholeGenomeBisulfiteSequencing,WGBS)和RNA-seq对两个品种牛背最长肌DNA甲基化和转录组进行分析,筛选牛肉质性状相关候选基因和候选区域,并对部分候选基因和候选区域进行了功能验证和作用机制分析。
北京百迈客生物科技取得一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法专利，实现对动植物功能基因的高效挖掘 金融界2024年8月20日消息，天眼查知识产权信息显示，北京百迈客生物科技有限公司取得一项名为“一种联合基因组三维结构差异鉴定和转录组基因表达水平差异分析挖掘功能基因的方法“...