近日,上海交通大学农业与生物学院和生命科学技术学院联合在《Nature Communications》发表新研究成果!本研究从水稻根际土壤中分离出假单胞菌P. mosselii 923,该菌株特异性抑制稻黄单胞菌和稻瘟病菌的生长,为防治水稻病原菌提供了更广阔的选择。 本研究的细菌基因组完成图和转录组测序和分析由上海派森诺生物科技股份...
2016至2018年间,本单位从全省32家医疗机构累计收集713株结核分枝杆菌临床株,其中对氨基糖苷类敏感的有617株,对氨基糖苷类耐药的有96株;基因组测序结果表明,氨基糖苷类耐药菌株的基因突变类型主要包括eis -10G>A、eis -14C>T、 rrs C462T、rrs 514A>C、rrs A1401G和 tlyA 513-514 del,其中rrsA1401G的比例...
对41个FL样本(POD24,n=11,non-POD24,n=30)的转录组数据进行分析。与non-POD24亚型相比,在POD24亚型中观察到独特的基因表达谱,包括一组上调基因(n=434),如MME、CXCR1、CD5L、HLA-G、IL27、ZNF365和几种主要组织相容性复合体I类(MHC I)分子相关基因,以及一组下调基因(n=840),如CCND1、CXCL8、TP73和...
基因组重测序是挖掘候选基因的重要手段,转录组测序则是研究基因表达量差异的主要方法。通过基因组重测序中的全基因组关联分析(GWAS )、数量性状基因座(QTL)等方式可以挖掘到重要性状的关键候选基因。通过比较两个差异表型样本的转录组数据,可以研究通过重测序手段得到的候选基因的表达量情况,两者相结合可以便于后续研究分...
每个点对应一个样本,颜色对应于每个组。VEGF:血管内皮生长因子,VEGFR1:血管内皮生长因子受体1 结论: 本研究通过WGBS和对应的RNA-seq对人的全血DNA甲基化水平和转录组基因表达进行全基因组测序分析,证明了与吸烟潜在相关的分子变化。通过比较吸烟者和非吸烟者的DNA甲基化水平,发现吸烟诱导的DMR在高甲基化和低甲基化区域...
文章中结合大样本滤泡性淋巴瘤(follicular lymphoma, FL)病例临床病理特征分析、WES、RNA-seq和单细胞转录组测序(scRNA-seq),为我们提供了第一项全面的滤泡性淋巴瘤患者与POD24相关的基因组和转录组学研究,描述了伴有POD24的滤泡性淋巴瘤患者明显的临床、遗传和分子特征。