在Materials Studio中,我们可以使用分子动力学模拟来计算均方位移曲线。以下是一种可能的步骤: 1.设置模拟参数:首先,你需要设置模拟的参数,包括温度、压力、模拟盒子的尺寸、原子类型和数量等。 2.运行模拟:设置好参数后,你可以运行模拟。模拟完成后,你会得到一系列的输出文件,包括轨迹文件(通常以.dcd或.xyz格式存储...
-s nvt.tpr -o msd.xvg(不太确定对不对，我见别人是gmx msd traj.gro -n)也得到了均方位移曲线...
说明原子有许多又回到原来（t=0）位置了
在线: 63.2小时 虫号: 4230820 注册: 2015-11-19 性别: GG 专业: 理论和计算化学 引用回帖:4楼:...
如题，同一个体系选用随机速度计算两次，均方位移曲线会不会差距很大，感谢您的回复。
均方位移曲线反映了什么 返回小木虫查看更多分享至: 更多 今日热帖autodock... 请教关于DPD确... MS模拟无定型活... 2016年新著—... 使用Materi... MS计算的能量值... 求大神指点,MS... packmol ...精华评论 猜你喜欢板块导航 网络生活 资源共享 化学化工 专业学科 科研生活 生物医药 材料 ...
如何用VMD得到其均方位移曲线MSD，有没有其他比较好用的软件可以做出均方位移曲线，键角分布，结构因子，...
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