6.g:Profiler,基因富集分析主要用到g:Profiler中的g:GOSt小工具,涉及到的功能注释数据库除了常见的GO和KEGG,还有Reactome、WikiPathways、TRANSFAC、miRTarBase、Human Protein Atlas等。 工具链接: https://biit.cs.ut.ee/gprofiler/gost 7.WebGestaltWEB-based GEne SeT AnaLysis Toolkit(WebGestalt)是一个综合的功...
在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天就来介绍一下如何使用在线分析工具DAVID与KOBAS的进行KEGG通路富集分析。 操作步骤 进入DAVIDhttps://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp ...
在线富集分析metascape,可做任何物种,无代码只要有手就行,结果包含KEGG,GO(BP,CC,MF)等,基因功能注释分析工具, 275276 2759 0 【生信分析-7】GO+KEGG富集分析工具Metascape 恶霸小猴子 3.4万 17 免费在线富集分析网站,GO、KEGG富集分析——DAVID与KOBAS在线分析工具 275276 1.3万 4 Metascape基因富集分析 46285...
给大家推荐一个进行在线GO富集分析的网站 GOrilla:http://cbl-gorilla.cs.technion.ac.il/可以针对几种比较常见的动植物进行GO富集分析。 1、第一步是选定物种,下拉列表中的物种涉及了以下几种: Arabidopsis thaliana 拟南芥 Saccharomyces cerevisiae 酿酒酵母 Caenorhabditis elegans 秀丽隐杆线虫 Drosophila melanogaster ...
了解KEGG通路富集分析的步骤，主要使用DAVID与KOBAS这两个在线分析工具。操作流程如下：首先，访问DAVID网站，上传基因列表，选择合适的物种，然后开始分析。在转换环节，选择ENTREZ_GENE_ID作为格式，转换完毕后，下载结果。打开Excel查看富集通路、基因及校正值，并通过网页链接获取详细信息。接着，转向KOBAS网站...
对于单个基因列表,默认进行富集分析和PP分析,如下所示,输入基因列表,选定物种, 然后点击Express Analysis即可 结果包含以下两种 1. 富集分析的柱状图 默认使用GO, KEGG, Reactome, CORUM等多个数据库进行富集分析,结果如下所示 用柱状图的形式展示top15个显著富集的terms, 示意如下 ...
在进行差异基因表达分析时,得到显著差异基因后,接下来就需要分析这些基因参与了哪些功能,常见的就是GO功能注释和KEGG通路富集分析,今天就来介绍一下如何使用在线分析工具DAVID与KOBAS的进行KEGG通路富集分析。操作步骤 进入DAVIDhttps://david.ncifcrf.gov/conversion.jsp ...
http://metascape.org Metascape(http://metascape.org/) 是一个功能强大的基因功能注释分析工具,整合了GO、KEGG、Uniprot等多个权威的功能数据库 能帮助用户将当前流行的生物信息学分析方法应用到批量基因和蛋白质的分析中,以实现对基因或蛋白功能的认知。只需在Metascape网页几步简单的操作,就可以对大批量的基因或...