与拟南芥和水稻等基因组中高度相似的着丝粒卫星重复序列不同,同源四倍体马铃薯基因组在同源单倍型上展示出明显不同的周着丝粒和着丝粒特征,表明着丝粒序列的快速进化。 结论5.3 野生马铃薯在C88基因组的渐渗 野生物种的引入被认为增加了栽培作物的杂合性。 通过将20份野生二倍体马铃薯的HiFi数据比对到C88基因组,发现C88...
摘要 马铃薯起源于安第斯山脉,通过短日照依赖性的块茎发育演化出通过营养器官进行繁殖的策略。本文中,作者报道了一个四倍体马铃薯栽培种的高质量、染色体级别参考基因组。该基因组的大小为2.67Gb,scaffold N50长46.24Mb,contig N50长2.19Mb。通过从头...
2022年3月3日,来自德国慕尼黑大学和马克斯·普朗克植物育种研究所 (科隆) 的研究团队在Nature Genetics发表了题为Chromosome-scale and haplotype-resolved genome assembly of a tetraploid potato cultivar的研究论文,首次破译了高度复杂的四倍体马铃薯基因组,有望快速推进马铃薯优良品种的选育进程。 课题负责人Korbinian Sch...
通过比较基因组研究发现四倍体马铃薯与二倍体马铃薯基因组在错配修复(MMR)中存在显著差异,同时基于“青薯9号”四倍体马铃薯基因组,对150份马铃薯块茎肉色进行全基因组关联分析并挖掘了候选基因。 该研究对高度杂合的同源四倍体栽培种马铃薯“青薯9号”品种进行测序和组装,得到了大小为2.67Gb的基因组(contig N50为2.1...
传统栽培的马铃薯是同源四倍体,基因组复杂,其紫茎与绿茎互为相对性状,纯合紫茎RRRR与纯合绿茎rrrr杂交获得F1,下列叙述不支持“F1植株在减数分裂过程中,同源染色体联
Fig.3 马铃薯性状关联分析表明,CIP群体中各农艺性状之间存在密切的相关性。 CIP群体农艺性状多样性丰富,但群体分化不明显,为GWAS定位奠定了良好基础。考虑到同源四倍体马铃薯基因组的缺失和多倍体GWAS的局限性,该研究使用GWASpoly将同源四倍体基因型与最新揭示的单倍体基因组数据关联分析(DM v6.1), 共鉴定出50个关联信...
Sage Science全自动DNA片段回收仪多型号协同助力同源四倍体马铃薯基因组结构与遗传研究 背景知识 马铃薯是全球消费量最大的非谷类粮食作物。大多数商业马铃薯品种是同源四倍体,具有高度杂合的基因组,严重阻碍了遗传分析和改良。栽培马铃薯主要是无性繁殖,加上四倍体遗传,传统的马铃薯育种效率低下,与玉米和水稻等其他主要作物...
通俗地说,就是有四套基因组。我们人类是二倍体物种,遗传比较简单,而四倍体物种就比较复杂,无论是做育种还是做其他研究,挑战都非常大。马铃薯遗传的复杂性,导致育种过程非常缓慢,全世界还有上百年的老品种仍在大面积种植。比如,美国的薯条加工型品种Russet Burbank,是1902年育成的,至今仍是美国的第一大品种。中国...
许智宏:马铃薯因其高产而且营养丰富,又适于加工成各种不同的产品,已成为我国第四大粮食作物。但和水稻、小麦和玉米等主粮作物相比,马铃薯的育种进展比较缓慢。原因是栽培马铃薯是依靠薯块进行无性繁殖的同源四倍体物种。四倍体马铃薯基因组高度杂合,这给遗传分析带来不少困难,而且还有很多有害突变隐藏在四套基因组中,很难...
是二倍体 四倍体很复杂，全是杂合的！