哈迪温伯格平衡检验 哈迪温伯格平衡检验 哈斯温伯格定律Hardy–Weinberg equilibrium(Hardy–Weinberg principle ,HWP)及检验 群体中代与代之间等位基因频率(allele frequency)基因型频率(genotype freqency)恒定f(AA) = p2 f(aa) = q2 f(Aa) = 2pq。对应等位基因频率(allele freqency)的计算 ...
卡方检验和拟合优度是评估观察到的基因型频率是否符合哈迪温伯格平衡的常用方法。 2.哈迪温伯格平衡。 哈迪温伯格平衡是由英国生物学家戴维·哈迪和伯纳德·温伯格提出的。它描述了一个理想化的遗传群体,其中基因型频率在世代之间保持稳定。在哈迪温伯格平衡中,假设存在两个等位基因,分别用p和q表示,它们的频率分别为p...
摘要: 哈迪-温伯格平衡定律 Hardy-Weinberg equilibrium, HWE 是群体遗传学中最重要的原理, 是群体有性繁殖上下 代之间基因频率与基因型频率是否保持平衡的检验尺度。 在 HWE 检验时通常需要对各基因频率作估计。 研究了存在显 隐性时基因频率的极大似然估计值的牛顿迭代算法, 牛顿迭代算法的收敛速度快于 EM 算法;...
应用Hardy-Weinberg遗传平衡吻合度检验方法,把计算得到的基因频率代入,计算基因型平衡频率,再乘以总人数,求得预期值(e)。把观察数(O)与预期值(e)作比较,进行χ2检验。病例组和对照组的基因型分布的观察值和预期值差异无显著性(P>0.05),符合遗传平衡定律:for example,下表为一个具体的Hardy-Weinberg遗传平衡检验。
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哈迪-温伯格平衡定律(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)是群体遗传学中最重要的原理,是群体有性繁殖上下代之间基因频率与基因型频率是否保持平衡的检验尺度.在HWE检验时通常需要对各基因频率作估计.研究了存在显隐性时基因频率的极大似然估计值的牛顿迭代算法,牛顿迭代算法的收敛速度快于EM算法;讨论了最小Pearson χ2统计...
当P值小于0.05的时候,是拒绝零假设,也就是说偏离哈迪温伯格平衡的。一个是卡方检验一个是似然法,...
Hardy-Weinberg equilibrium tests 可以参考genhw命令 http://www.stata.com/meeting/13uk/slides_nshephard.pdf http://biostat-resources.com/stata/des_hwsnp.htm
大家好,本人在实验中采用微卫星分型,现在不知道如何来检验得到的结果是否符合哈迪温伯格平衡,特此请教,...
偏离哈迪温伯格平衡 (受到选择的标志) Deviations from Hardy–Weinberg equilibrium Significance tests for deviation偏离显著性检验。通常用Pearson’schi-squared test.使用观察到数据的基因型频率以及通过HWP得到的预期基因型频率。 Pearson卡方检验,使用从数据获得的观测基因型频率和使用HWP获得的预期基因型频率。