紫花苜蓿基因组组装过程:(1)使用Canu默认参数,利用CCS clean reads组装contigs。组装得到的Contig N50值为459kb,总长度为3154Mb。(2)使用HiC-Pro将Hi-C reads与contigs 进行比对,产生比对BAM文件。(3)使用注释的蒺藜苜蓿蛋白作为参考,完全基于同源的策略注释contigs。对138,729个同源基因进行了结构注释。用MCscan用于...
图1 减数分裂同源重组过程中染色体组装的分子机制 总的来说,在这项工作中,作者解析了有关减数分裂双链断裂的关键组成部分与哺乳动物染色体轴形成之间相互作用的关系,并提出三种基因组位点类型有助于减数分裂染色体的环/轴的组装:PRDM9依赖的热点区、...
当用Hi-C技术挂载染色体时,同源染色体之间的Hi-C交联信号会将序列相似度极高的等位片段连接在一起,导致同源染色体被错误的连接到一起,形成大量嵌合的组装。 福建农林大学基因组与生物技术研究中心(基因组中心)明瑞光团队一直致力于多倍体基因组学研究,并于2018年8月份利用ALLHiC算法成功破译同源多倍体甘蔗割手密基因组 (...
随着技术的不断发展和完善,相信酵母同源重组技术将会在更多的领域得到应用和推广。酵母组装 与 长片端DNA合成 DNA组装与转移技术是合成生物学的核心使能技术之一。生命体设计改造的复杂度不断提升,使得对大片段DNA组装与转移技术的需求也日益旺盛.。小片段DNA的组装与转移技术目前已经比较成熟,大片段DNA由于其分子量...
同源重组(Homologous recombination)是一种在进化上十分保守的DNA修复途径,用于保护基因组的稳定性。在分子克隆领域,同源重组长期以来一直被应用于在体内和体外组装多个DNA双链片段。其中许多组装方案的可行性依赖于多种类型的酶活性,例如目前应用...
2022年6月2日,福建农林大学海峡联合研究院基因组中心张积森教授团队利用基因组学手段完成了高难度的同源多倍体基因组组装,并系统的阐明了甘蔗细茎野生种的起源、遗传背景及群体进化,深入挖掘了关键性状相关基因的演化过程,相关研究成果荣登Nature Genetics。 为了加强学术的交流以及促进科研成果更广泛的传播,百迈客将邀请福...
同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的装置专利信息由爱企查专利频道提供,同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的装置说明:本发明公开了一种同源四倍体基因组分型组装的方法和装置、构建染色体的方法和装置及其应用。该分型组装的方...专利查
抗体序列同源标签组装软件是由北京理工大学著作的软件著作,该软件著作登记号为:2024SR0352017,属于分类,想要查询更多关于抗体序列同源标签组装软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
生命学院魏迪明合作开发基于同源重组的方法组装DNA片段和纳米结构,作者:清华人,简介: 生命学院魏迪明-大学生竞赛活动社区
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