HRD导致结果：当存在HRD时，DSB会过度依赖NHEJ、MMEJ等替代性损伤修复途径，极可能造成核酸序列的插入/缺失、拷贝数异常等，并引起染色体交联，造成基因组和染色体不稳定，其表象就是基因组疤痕（包括基因组杂合性缺失(loss of heterozygosity, LOH)、端粒等位基因不平衡(telomeric allelic imbalance, TAI)和大片段迁移(...
NHEJ)、微同源末端连接(microhomology mediated end joining,MMEJ)和单链退火途径 (single-strand annealing,SSA)等低保真、高易错的替代性DNA损伤修复途径,从而极可能造成核酸序列的插入/缺失,拷贝数异常,并引起染色体交联,造成基因组和染色体不稳定。
HRD阳性的患者通常PARPi敏感,无法正确修复的DNA损伤会在整个基因组层面留下“瘢痕”,同源重组修复缺陷(HRD)通过检测基因组层面留下的痕迹及相关通路基因来评估修复缺陷的程度。 HRD score检测是目前比较公认的评估HRD状态的方法,需要综合三方面指标:杂合性缺失(LOH),端粒等位基因不平衡(TAI)及大片段迁移(LST),全面评...
图3. 通过同源重组 (HR,homologous recombination) 或非同源末端连接 (NHEJ,non-homologous end joining) 修复 DNA 断裂。通过同源重组修复 DNA 断裂 当 DNA 双链体的两条链被紧密切割时发生双链断裂 (DSB),将染色体分成两个不同...
HRD评分是基因组疤痕的评估利器。同源重组修复缺陷(HRD)指的就是当DNA出现双链断裂时,细胞失去了通过同源重组的方式对断裂进行修复的能力。HRD可致“基因组疤痕”现象(genomic scars),包括基因组杂合性缺失(LOH)、端粒等位基因不平衡(TAI)、大片段迁移(LST)等。
同源重组修复作为核心的DNA损伤修复方式之一,它主要发生在细胞周期的S和G2期,是维持基因组完整性确保遗传信息高保真传递的一种DNA修复机制。同源重组修复(homologous recombination repair, HRR)和PARP(poly(ADP-ribose)polymerase)是DNA损伤修复的两种重要机制,其中HRR参与DNA双链损伤修复,PARP负责DNA单链损伤修复。
基于ChinaMap中国万人数据库筛选的41000+高质量单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphisins, SNPs) ,通过分析杂合性缺失(Loss of Heterozygosity, LOH)、端粒等位基因不平衡(Telomeric Allelic lmbalance, TAI)和大片段迁移(Large-scale State Transitions, LST)等,计算出基因组不稳定性评分(GenomicInstability ...
2023年6月12日,南京师范大学生命科学学院的郭志刚/潘飞燕课题组在同源重组修复的调控机制方面取得新进展。研究成果“GAPDH facilitates homologous recombination repair by stabilizing RAD51 in an HDAC1-dependent manner”以长文形式发表于国际经典学术期刊EMBO Reports上。(拓展阅读:郭志刚课题组相关工作,详见“岚翰生命...
图1 基因组瘢痕类型 [3] 不仅正常细胞可以使用这些修复途径,癌细胞也能在不断增殖的细胞中修复损伤DNA。聚腺苷二磷酸核糖聚合酶(PARP)是一种DNA修复酶,它通过识别结构损伤的DNA片段而被激活,在DNA修复通路中起关键作用。携带同源重组修复缺陷(HRD)的肿瘤患者,使用PARP抑制剂,可以抑制PARP酶的功能使DNA损伤修复途径...
同源重组修复(Homologous Recombination Repair,HRR)和多聚ADP-ribose聚合酶(Poly ADP-ribose Polymerase,PARP)修复,是两种重要的DNA损伤修复机制,分别参与DNA双链和单链损伤修复。HRR通路中的BRCA1/2等基因突变会导致同源重组缺陷(Homologous Recombination Defect,HRD)(图1)[1]。PARP抑制剂可抑制肿瘤细胞的DNA单链损伤...