同源序列的查找,顾名思义就是我们要找的是和这个序列相似的序列,比如拟南芥,我们找到这个植物的一个序列,那就是把一个数据库当作比对的参照物,把这个一个拟南芥的序列与这个数据库进行比较,查看那些物种的序列和这个序列相似,这个是线上的方法,我们直接利用ncbi中的官网的方法比较blast,也可以使用一种本地的方法,就是在集群上进行比较,这个
可以通过左侧的物种筛选进行过滤如下图，并可以通过相似度进行排序，快速准确地找到高相似度的同源序列。
寻找NCBI上不同种属基因的同源序列是一项直接且简单的操作。首先，打开浏览器，直接输入并访问NCBI的官方网站。进入网站后，你会看到一个搜索框，这是你获取所需信息的关键入口。在搜索框中，输入你想要查找的特定基因名称，然后开始你的搜索。这个搜索过程可能会根据你的查询内容提供相关建议，确保你输入的...
打开NCBI的搜索引擎，输入"ALA"，你会看到如阿拉氨酸脱氢酶 [ Archaeoglobus fulgidus DSM 4304 ] 的详细信息。滑动页面，定位到"General gene information"部分，进一步探索"Homology"链接，你会发现大量直系同源序列的宝藏。在选择比对方式时，通常建议优先考虑蛋白质序列比对，因为它们较DNA序列更短，且包含...
在Phytozome上查找同源基因序列可以按照以下步骤进行: 打开Phytozome网站并登录账户: 首先,访问Phytozome的官方网站:Phytozome。 如果还没有账户,需要先注册一个账户并登录。 在搜索框输入目标基因名称或ID: 在Phytozome的主页上,你会看到一个搜索框。 在搜索框中输入你感兴趣的目标基因的名称或ID。 选择合适的物种和...
1 首先登陆https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed，NCBI首页。点击首页下端BLAST,进入blast界面。2 BLAST界面提供blastn，blastp，blastx，tblastn，tblastx等选项。已知蛋白序列，查找某菌种对应的同源基因信息，点击tblastn 3 点击进入后，复制蛋白序列到序列框，或者“选择文件”。选择Organism。完成上述信息后，点击...
(1)首先在NCBI数据库中搜索查找拟南芥CYP704B1基因的蛋白质序列然后下载并且保存为F A S T A 的格式,命名为拟南芥CYP704B1基因氨基酸序列。(2)在 NCBI的BLAST程序中进行同源蛋白质的blast,blast的对象为rice,进行blast完后找到相似度最高的水稻蛋白质序列,点击保存为FASTA格式,命名为Os04g0573900[Oryza sativa ...
1、 通过浏览器浏览设备直接搜索NCBI，选择对应网站略过。2、此时会弹出一个新的窗口，需要根据实际情况搜索相关信息。3、如果下一步没有问题，点击图标进入。4、这样就可以看到结果，并在NCBI上寻找已发表的不同物种基因的同源序列。
序列对比，你先确定所要比对的品种，找到相应的水稻CDNA文库，检索就可以了。直接
不是很明白你的问题.你想要鉴定这个细菌的话,可以直接对16s测序(或者你已经有序列了?),然后blast一下.如果你已经知道了这株细菌的可能种名,可以在ncbi上搜几个同属的序列出来比较一下. 分析总结。 是刚刚分离出来的一株细菌想进行鉴定如果从10srdna入手的话引物如何确定不是要从同源序列查找么结果...