进行了叶绿体基因组生物信息分析方法的实践应用以及30个植物叶绿体基因组的分析和报道.本研究的主要结论如下:(1)基因组特征分析表明木姜子属,芭蕉属和睡莲属的叶绿体基因组是典型的四分体结构,包括一个大单拷贝区域(LSC),一个的小单拷贝区域(SSC)和两个相同的反向重复区(IRs);物种叶绿体基因的种类和数量基本一致,...
摘要:为解析紫苏的叶绿体全基因组结构和功能,研究采用REPuter、MISA、CodonW和Prep-Cp软件分析了紫苏叶绿体基因组的重复序列、SSR位点和密码子偏好性,并对RNA编辑位点进行了预测。结果显示,对紫苏叶绿体基因组中大于300bp的59条CDS序列检测分析得到60个重复序列,多以F和P形式存在,且主要分布于LSC区和IRA区,与光合作用...
试比较对大肠杆菌、链孢霉、玉米和人类进行基因的连锁分析时使用方法的异同,这些分析方法所依据的基本原理是什么根据这一原理能否作出对植物的叶绿体基因组和动物的线粒体基因组进行
本发明公开了一种基于叶绿体基因组测序的杜鹃花科植物分析方法,包括如下步骤:S1,取样,DNA提取与测序,以锦绣杜鹃为实验材料,采集其新鲜的叶子,使用改良的CTAB方法提取总基因组DNA,通过250bp的双末端测序并获得相应数据;S2,叶绿体基因组组装;S3,叶绿体基因组注释;S4,叶绿体基因分析;S5,全基因组比较与分析;S6,系统进化...
专利摘要:本发明公开了一种基于叶绿体基因组测序的杜鹃花科植物分析方法,包括如下步骤:S1、取样,DNA提取与测序,以锦绣杜鹃为实验材料,采集其新鲜的叶子,使用改良的CTAB方法提取总基因组DNA,通过250bp的双末端测序并获得相应数据;S2、叶绿体基因组组装;S3、叶绿体基因组注释;S4、叶绿体基因分析;S5、全基因组比较与分析...
本发明公开了一种基于叶绿体基因组测序的杜鹃花科植物分析方法,包括如下步骤:S1、取样,DNA提取与测序,以锦绣杜鹃为实验材料,采集其新鲜的叶子,使用改良的CTAB方法提取总基因组DNA,通过250bp的双末端测序并获得相应数据;S2、叶绿体基因组组装;S3、叶绿体基因组注释;S4、叶绿体基因分析;S5、全基因组比较与分析;S6、系统...