DNA序列反向互补是指将一个DNA序列的核苷酸顺序逆转并互补。互补是指将DNA序列中的核苷酸按照碱基配对原则进行配对,即A与T配对,C与G配对。而逆转是指将DNA序列中的核苷酸顺序逆转,即从后往前排列。 例如,一个DNA序列为5'-ATCG-3',其反向互补为5'-GATC-3'。
使用python自动生成DNA的反向互补链, 视频播放量 1766、弹幕量 0、点赞数 29、投硬币枚数 5、收藏人数 28、转发人数 6, 视频作者 会飞的小石头96, 作者简介 有问题可以QQ邮件812916434。假如有帮助到你,请将这份善意传递下去,相关视频:看看如何剔掉大脑这团血管,全世界
在生物信息学分析中,经常对DNA序列进行一系列操作,包括子序列截取,互补序列获取,反向序列获取,反向互补序列获取。在python语言中,可编写如下函数完成这些简单功能。 子序列截取 python中对序列截取使用字符串切片功能就可以完成,例如: >>> seq="ATGATATAGtatatatgCAAGAGg">>> subseq = seq[1:6]>>>subseq"TGATA...
在生物信息学分析中,经常对DNA序列进行一系列操作,包括子序列截取,互补序列获取,反向序列获取,反向互补序列获取。在python语言中,可编写如下函数完成这些简单功能。 子序列截取 python中对序列截取使用字符串切片功能就可以完成,例如: >>> seq="ATGATATAGtatatatgCAAGAGg">>> subseq = seq[1:6]>>>subseq"TGATA...
DNA='ATTTAGCGATGCGGCTATGCTATCGGA' 如果大家只是想解决这个问题,可以使用下面提到的三个网页工具 1.https://www.bioinformatics.org/sms/rev_comp.html 将你的序列贴进对话框,点击SUBMIT就能得到方向互补序列 2.https://arep.med.harvard.edu/labgc/adnan/projects/Utilities/revcomp.html ...
工具/原料 DNAMAN软件 方法/步骤 1 打开DNAMAN软件 2 点击File，选择new 3 在新出现的对话框中输入DNA序列，如图所示 4 同时按住键盘上Ctrl和A，选中序列，并单击如图所示“seq”5 之后依次选择Sequence，Display，并单击Rev.Compl.Sequence 6 最终得到原序列的反向互补序列 注意事项 注意步骤的每一个细节 ...
在Python中,是没有switch语句的,可以用if...elif...elif..else来模拟switch语句;而更pythonic的做法是用字典来代替。在本题中,你可以尝试用if...elif...else来实现反向互补。 Python中的序列反向可以通过切片实现,如dna_forward[::-1],就得到了其反向序列,再求其互补序列,也可以实现反向互补的需求。
在上述方法中,在创建 reversed_strand 时,会为输入 DNA 链中的每个字符创建一个新字符串。如果输入的 DNA 链太长,这在时间和内存方面可能会很昂贵。为了避免这种情况,我们可以使用列表来使用 Python 获取 DNA 链的反向互补。我们将使用以下步骤使用 for 循环、列表和 join() 方法来反向互补 DNA 链。
vi test.fa >123 AGCTAGCTAAAA >456 AAAATTTTCCCC 使用方法: 反向互补: revseq -sequence test.fa -outseq output.fa -notag cat output.fa >123 TTTTAGCTAGCT >456 GGGGAAAATTTT 反向不互补: revseq -sequence test.fa -outseq output.fa -notag -nocomplement ...
#seq对象有内置的获得互补和反向互补的函数 >>> from Bio.Seq import Seq >>> from Bio.Alphabet import IUPAC >>> my_seq = Seq("GATCGATGGGCCTATATAGGATCGAAAATCGC", IUPAC.unambiguous_dna) >>> my_seq Seq('GATCGATGGGCCTATATAGGATCGAAAATCGC', IUPACUnambiguousDNA()) ...