PCP可表现为重症肺炎[氧分压58毫米汞柱(范围50 - 70)]与CT上空边征(80.4%)和双边毛玻璃(89.3%)。可广泛的合并感染,尤其是肺部感染,在28%–71%的患者中存在,可能有多个涉及的病原体如金黄色葡萄球菌,革兰氏阴性细菌,曲霉菌种或巨细胞病毒(CMV)。在接受异基因造血干细胞移植患者中,PCP与CMV相关肺炎占50%。