比较基因组学分析显示,南丹参基因组中大多数扩张的基因都参与苯丙烷代谢、酪氨酸代谢和类萜生物合成。 南丹参系统发育树及其进化分析 前期研究表明,迷迭香酸是丹酚酸B生物合成的直接前体,漆酶(laccase)参与催化迷迭香酸到丹酚酸B的氧化反应。系统发育分析表明,南丹参漆酶家族成员的数量高于丹参。我们推测漆酶家族成员的扩张能有效
该研究综合利用PacBio、Illumina以及Hi-C测序技术,构建了南丹参染色体级别的高质量参考基因组。该基因组大小约为462.44Mb、scaffold N50长为57.96 Mb,共注释了44,044个蛋白编码基因。基因组演化分析估计南丹参与其近缘种丹参的分化时间约为394万年前,并且南丹参经历了一次全基因组复制事件。比较基因组学分析显示,南丹参...