一般来说,差异表达的分析会依赖于统计学的显著性检验,比如使用t检验、Wilcoxon秩和检验等,来判断两个基因在两个不同条件或时间点的表达量是否有显著差异。所以说,确定PCT1和PCT2多少为差异表达,需要结合具体的实验数据和分析方法来决定。
plot_all()函函数可完成所有上述介绍的可视化方案(默认参数),并且将所有图片以png和pdf的格式保存在输入的outdir文件夹下。 除此之外,cellPCT还提供了多个可调参数,并将绘图函数的结果以ggplot2对象作为输出。可以在此基础上进一步个性化自己的图片展示,满足丰富多彩的个性化绘图需求。cellPCT全部参数如下(更多细节还请...
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