最后他们总结了一个model:TAD formation was helped by loop extrusion, and establish CTCF as the major factor defining domain boundaries genome-wide。 CTCF Does Not Constrain H3K27me3 Spreading in mESCs and Summary Model 总的来说,看的第一篇Hic的文章,还有很多值得继续了解的地方...
研究团队设计的SnapHiC算法可以从少量细胞的scHi-C数据集中以高分辨率和高准确度识别染色质环。对来自mES细胞的已发布scHi-C数据的重新分析表明,SnapHiC极大地提高了对染色质环的检测能力。将SnapHiC应用于来自人类前额叶皮层细胞的sn-m3C-...
继续打卡HIC相关的一些文章。这篇是16年在Cell Systems上的一个方法类的文章,题目是:Juicer Provides a One-Click System for Analyzing Loop-Resolution Hi-C Experiments。Juicer这个方法和Hic pro算是目前最常用的两个HiC的数据分析方法了。 文章很短,一个主图和一个table.不过他们这个Graphical Abstract设计的挺...
结果还显示该染色质环结构在星形胶质细胞中的特异性:因为该结构并没有在其它细胞类型中(如神经细胞neurons、小胶质细胞microglia和寡突胶质细胞oligodendrocytes)出现。 算法SnapHiC填补了利用单细胞Hi-C数据进行可靠染色质环鉴定方法领域的空白,极大的提高了从少量单细胞Hi-C数据中识别染色质环的检测效能,有助于未来更...
以下不属于单细胞生物的是〔 〕 根据您输入的内容,为您匹配到题目: **以下不属于单细胞生物的是〔 〕** A. 衣藻 B. 珊瑚虫 C. 变形虫 D. 酵母菌 **答案**: [答案]B [解析] 解:A、C、D都是由一个细胞构成的生物,属于单细胞生物;...
新技术实现幽门螺杆菌单细胞精准诊疗 幽门螺杆菌单细胞精准诊疗技术CAST-R-HP。青岛能源所供图 本报讯幽门螺杆菌是人类最常见的慢性感染细菌,全球约半数人口感染幽门螺杆菌,70%以上的胃癌与幽门螺杆菌感染有关。中科院青岛生物能源与过程研究所、中国疾病预防控制中心传染病预防控制所(中国疾控中心传染病所)、青岛市...
单细胞Hi-C(scHi-C)测序技术被用于单个类型细胞中研究染色质结构,是研究组织中异质性细胞的有力工具。但目前仍缺乏从scHi-C数据中以高分辨率分析染色质环的工具,因此研究团队开发出一种名为SnapHiC的计算方法。这是一种为scHi-C数据定制的计算方法,可从少量单细胞中以高分辨率和高准确度识别染色质环。