单细胞转录组学:讨论了单细胞RNA测序(scRNA-seq)如何改变了我们对细胞多样性和基因表达动态的理解,并讨论了样本处理、数据整合、识别微妙的细胞状态、轨迹建模、去卷积和空间分析等方面的进展。 空间转录组学:探讨了空间转录组学如何将单细胞置于多细胞邻域中,并识别空间上重现的表型,即生态型(ecotypes)。 临床转化:...
单细胞转录组测序可精准洞察单个细胞内基因表达的细微差异,绘制细胞功能活动的 “基因画像”;表观基因组测序则聚焦于挖掘 DNA 甲基化、组蛋白修饰等表观遗传信息,恰似掌控基因表达的 “隐形开关”,深刻左右基因的表达状况。二者联合,能整合基因表达动态与表观遗传调控信息:借单细胞转录组数据,明确基因在不同细胞情境下...
单细胞转录组测序可精准洞察单个细胞内基因表达的细微差异,绘制细胞功能活动的 “基因画像”;表观基因组测序则聚焦于挖掘 DNA 甲基化、组蛋白修饰等表观遗传信息,恰似掌控基因表达的 “隐形开关”,深刻左右基因的表达状况。二者联合,能整合基因表达动态与表观遗传调控信息:借单细胞转录组数据,明确基因在不同细胞情境下...
Live-seq可实现顺序单细胞转录组学采样：展望 03 Live-seq可以在不同的时间点对同一细胞进行单细胞转录组、下游分子和功能的分析。该成果有助于解决与细胞动力学或细胞表型变异有关的一些长期存在的生物学问题。研究团队计划对下一代Live-seq做出提升，以便对更多的细胞进行采样，旨在减轻统计能力和细胞分辨率问题。
一、单细胞转录组学能够揭示什么? 1.细胞间表达水平的变化:用单细胞转录组学可以探究单个细胞内基因表达水平变化。 2.细胞内转录调节:可以获得细胞内复杂的转录空间和神经信号调节,体内有特定基因表达特征,以及两个或多个细胞之间调控活动的识别。 3.基因编码的功能:从单细胞级别揭示细胞内的基因编码功能,可以提供丰...
1、首先通过单细胞转录组测序(scRNA - seq),筛选关键细胞类群,再对关键细胞类群进行实时轨迹分析、细胞通讯分析等多方面分析筛选关键基因。 2、其次进行表观组测序(包括 ATAC - seq、WGBS、CUT & Tag),筛选出关键基因位点及其修饰信息,进而锁定关键基因。
单细胞转录组:scRNA-seq 空间转录组:Spatial transcriptomic technique) 癌旁组织:Adjacent-normal (Adj-N) 肿瘤微环境:Tumor microenvironment 上皮-间充质转化:Epithelial-mesenchymal transition 稳健细胞类型分解:Robust Cell Type Decompos...
图1 原发性和配对转移PDAC组织的单细胞转录组学分析 Result2 导管细胞表现出高度异质性的CNV模式 作者根据每个亚群高表达的基因将导管细胞进一步分成6个亚群， MKI67+细胞几乎只出现在肿瘤组织中，提示肿瘤细胞具有高增值的能力。相反，RPS3+细胞是出现在NT组织的主要导管细胞群，表示这些细胞是恶性程度低的（称为“...
当前,单细胞测序相关的组学技术在农学领域的应用已经非常火热!仅从基迪奥生物合作客户的发表文章情况来看,单细胞转录组研究在农业养殖动物(如猪、牛、鸡、鱼类等)、农作物(如水稻、玉米、小麦、白菜等)、农业昆虫等领域得到了广泛应用。 现在,单细胞测序越来越便宜,看着别家师兄师姐利用单细胞技术发了那么多大文章,你...