2、箱体图的优点在于直观性的同时,可以显示出多个统计信息,如下是一个横向展示的箱体: PRF | 文案 关于百奥益康 北京百奥益康医药科技有限公司致力于提供前沿的单细胞及空间组学全套解决方案,相关研发和服务团队位于北京亦庄。 百奥益康现有管理和技术团队具有丰富的单细胞及空间组学服务和研发经验,在该研究领域深耕7年,
质控图。图1:上图展示了单细胞测序后的质控小提琴图,其中散点代表了每一个细胞,左边的图展示了每个细胞中鉴定到的基因数(nGene)的分布情况;右图展示了去重后的UMI数目的分布。 这个质控图可以方便我们了解此次单细胞测序的基本数据分布,以 - 一起实验网于20220929发
# 数据准备 data4boxplot = data.frame(Sample = colnames(pbmc$RNA), nFeature_RNA = pbmc$...
实用干货 | 单细胞数据质控可视化——箱体图 Seurat 中使用 VlnPlot() 函数基于 PBMC 数据绘制的小提琴图效果如下: 参考:https://satijalab.org/seurat/articles/pbmc3k_tutorial.html PBMC3k 的数据点比较少,而对于细胞数很多的情况,大家可能见过这种: 暂不论能反映多少信息(表达中位数、离群点...),但确实少...
2、箱体图的优点在于直观性的同时,可以显示出多个统计信息,如下是一个横向展示的箱体: PRF | 文案 关于百奥益康 北京百奥益康医药科技有限公司致力于提供前沿的单细胞及空间组学全套解决方案,相关研发和服务团队位于北京亦庄。 百奥益康现有管理和技术团队具有丰富的单细胞及空间组学服务和研发经验,在该研究领域深耕...
2、箱体图的优点在于直观性的同时，可以显示出多个统计信息，如下是一个横向展示的箱体：关于百奥益康 ...