10x Genomics利用液滴法的原理,通过微流控、油滴包裹和Barcode标记等技术,实现大规模的单细胞分离、标记,主要流程包括以下步骤: Step0、Prepare your sample(样品制备):酶解样品,制备单细胞悬液 Step1、GEM generation(生成油包水结构体系) Step2、Construct your 10x library(文库构建):构建用于测序的cDNA文库 Step3...
1、J IMMUNOTHER CANCER | 单细胞测序+空间转录组测序助力解析新型溶瘤腺病毒发挥多种协同抗肿瘤作用机理 2、SCI ADV | 欧易单细胞测序助力解析转录因子c-Maf介导细胞代谢调控γδ T17细胞发挥效应功能的作用机制 3、Front Cardiovasc Med | 单细胞测序助力解析主动脉夹层中免疫微环境特征 4、单细胞测序助力解析miR...
百奥益康现有管理团队和技术团队具有丰富的单细胞测序服务和研发经验,在单细胞研究领域深耕6年,曾成功领导打造了国内领先的单细胞科研服务团队,现已累积150+种不同组织类型、10,000+个样品的10x Genomics单细胞测序经验,累积服务客户发文数十篇,影响因子近千分(包括CNS顶级期刊)。
单细胞转录组测序(Single-cell RNA-sequencing, scRNA-seq) 是在单个细胞水平对mRNA 进行高通量测序的一项新技术,其原理是将多细胞生物分离的单个细胞中微量的转录组mRNA 通过高效扩增后再进行高通量测序。单细胞转录组测序能够有效解决组织样本无法破解的细胞异质性难题以及常规RNA-seq 被掩盖的细胞群内的转录组异质性...
10X RNA-seq/ST-seq质上就是转录组测序。某个物种是否可以用10X RNA-seq/ST-seq开展转录组研究,需要考虑两个方面的问题: (1)实验层面的问题 对于10X RNA-seq来说,主要考虑该物种是否可以制备单细胞或单细胞核悬液?大部分高等动物/植物的样本理论上都满足这个要求。而对于10X ST-seq主要要考虑该物种是否可以制...
#设置工作路径setwd('E:/project/test/')dir='E:/project/test/cellranger'#设置样本名samples=c("100","400")samples#获取单细胞数据sceList=lapply(samples,function(pro){print(pro)sce=CreateSeuratObject(Read10X(file.path(dir,pro)),project=pro,min.cells=5,min.features=200)return(sce)})#会自动...
10x Genomics单细胞转录组测序通过微流控分选单个细胞,然后通过带有barcode和引物的磁珠与细胞结合,被油滴包裹形成油包水结构,实现了对大量细胞的快速高效标记、测序和分析,获得单细胞水平转录表达信息,并依据特征基因的表达对不同细胞群进行鉴定和注释,实现样本、细胞群之间的差异分析、细胞演化过程以及细胞与细胞间的相互...
北京诺禾致源科技股份有限公司,提供单细胞转录组测序-10x Genomics 方案知识分享和检测服务,专注于生命科学与研究、肿瘤临床治疗建议、以及人类遗传领域,致力于成为全球领先的基因组学解决方案提供者。
应用单细胞测序技术研究科学问题越来越普遍,当下应用最火热的是10X Genomics公司的Chromium解决方案(以下简称10X)。但是基于2017年Christoph Ziegenhain et al[1]对6种单细胞转录组技术及2019 Broad研究所的团队对7种单细胞RNA测序方法进行了比...
10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术平台,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC。这篇文章将主要简述10X Genomics在单细胞基因表达检测方面,也就是scRNA-seq上的应用。 10X Genomics 一次测序可以捕捉100-80,000个细胞...