单细胞微生物基因组测序通过将单个微生物细胞分离并进行基因组DNA扩增,然后对其进行高通量测序,从而获得单个细胞的基因组序列。这种方法可以解决微生物群体中存在的细胞异质性问题,揭示不同细胞之间的遗传变异和功能差异。此外,单细胞测序还可以用于研究微生物在复杂环境中的生态功能和亚群体分化。 技术原理 技术原理图 应...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)的技术突破使细胞间的异质性不再神秘,而微生物单细胞转录组测序(MscRNA-seq)技术的问世即将揭开微生物群的层层面纱。 M20 Genomics通过独特的微生物裂解方式和基于随机引物的转录组捕获技术,于2022年3月,推出全球首个高通量单细菌转录组产品。该产品针对纯培养的单一菌种而设计,能够测得...
MobiMicrobe 技术的出现解决了主流微生物测序方法 16 S 扩增子测序无法用于病毒基因组测序以及参考序列数据库不完整的弊端，将在传统测序方法的基础上进一步推动微生物领域对未知菌株的开发，并在菌株的水平上精确分析其具体作用机制。因此它的出现在微生物领域引起巨大的轰动，该技术或将成为微生物领域 20 年内最令人振...
目前,单细胞微生物组测序技术包括单细胞扩增子测序、单细胞基因组测序和单细胞转录组测序。其中单细胞扩增子测序(BarBIQ)能够对微生物群落进行绝对定量;单细胞微生物基因组测序(EASi-seq)可以实现对数千种微生物基因组进行一次测序;单细胞微生物转录组测序(SmRandom-seq)能够对1万个单菌细胞转录组(~1000 genes/cell...
4℃冰箱内甲醛重悬细胞悬液震荡过夜固定 (2)防止细胞样品RNA降解:微生物单细胞测序样品制备操作全程需要在4℃下进行操作,另外细胞的重悬溶液中也要加入RNase抑制剂,防止细胞样品RNA降解; (3)保存与运输温度:微生物单细胞测序的不同类型的细胞样品需要遵照合适的保存和运输温度进行邮寄,温度过高或导致细胞样品RNA降解,...
的一种高通量的微生物单细胞转录组分析工具,它不仅可以鉴定新的细胞亚群、分析微生物表型异质性的分子机制、而且可以在单细胞分辨率下应用于微生物演化及微生物与宿主相互作用等领域的研究,其主要实验流程包括对微生物细胞进行固定透化后进行rRNA的去除,然后制备成合适浓度的单细胞悬液进行10×上机及后续文库构建和测序...
目前宏基因组技术常用的分箱组装算法存在两个问题:(1)菌株水平的分辨率;(2)无法准确描述质粒、噬菌体等可移动基因元件的归属问题。通过单细胞微生物基因组测序,由于测序获得的每一条reads都带有细胞条形码,可以精准区分每个细胞的基因组信息,从而实现同种不同株的检测精度,以及对水平基因转移事件的精准溯源。
1. 通过提取并比对各单细胞的基因组标志性信息(genomic signature),将样品中来自同一物种的单细胞微生物识别出来,然后合并在一起来组装出物种水平的参考基因组; 2. 进一步将单个微生物的基因组和参考基因组对比,识别来自于不同菌株的单细胞微生物并进行基因组组装。
1. 通过提取并比对各单细胞的基因组标志性信息(genomic signature),将样品中来自同一物种的单细胞微生物识别出来,然后合并在一起来组装出物种水平的参考基因组; 2. 进一步将单个微生物的基因组和参考基因组对比,识别来自于不同菌株的单细胞微生物并进行基因组组装...
一、单细胞测序技术原理 单细胞测序技术是一种能够微尺度下对单个细胞进行分析测序的技术。其核心是将一个个单细胞分离出来,使用某种方式将其细胞内DNA扩增,如PCR或MDA(多位移扩增)等方法,然后对扩增的DNA进行高通量测序,最终获得单个细胞的基因组序列信息。单细胞测序技术可以大幅提升微生物学和生物学领域中对单个细...