单拷贝直系同源基因构建进化树的主要步骤如下。 1. 准备好不同物种的序列文件,预测基因组的蛋白序列 prodigal (已知蛋白序列不用) 2. 单拷贝同源基因搜索 orthofinder 用于分析物种基因组中的单拷贝同源基因 使用命令:orthofinder -t 4 -a 2 得到的分析结果最好将序列ID重新命名一下,可以用seqkit、TBtools等软件批...