近日,北京理工大学霍毅欣教授团队在CRISPR/Cas9系统功能性sgRNA突变体筛选方面取得重要进展。相关研究成果以“Identification of functional sgRNA mutants lacking canonical secondary structure using high-throughput FACS screening”为题发表在Cell 子刊《Cell Reports》上(https://doi.org/10.1016/j.celrep.2024.114290)。...
近日,来自北京理工大学的霍毅欣等人在《ACS Synthetic Biology》上发表文章“Plasmid-Stabilizing Strains for Antibiotic-Free Chemical Fermentation”。作者介绍了一种基于荧光的高通量筛选方法,成功地从基因组部分片段缺失的大肠杆菌MG1655和枯草芽胞杆菌168菌株中筛选到质粒稳定菌株。 其中,大肠杆菌EcΔ50在无抗发酵中使...
近日,来自北京理工大学的郭淑元和霍毅欣实验室在bioRxiv上线文章“Design nonrepetitive and diverse activity single-guide RNA by deep learning”,开发了一个深度生成模型sgRNAGen,用于从头生成一系列具有活性的非重复和多样化的sgRNA。为了评估sgRNAGen产生的sgRNA的质量,研究通过靶向必需基因来评估它们的活性,结果表明,98...