列线图(Alignment Diagram)，又称诺莫图(Nomogram)，它是建立在多因素回归分析的基础上，将多个预测指标进行整合，然后采用带有刻度的线段，按照一定的比例绘制在同一平面上，从而用以表达预测模型中各个变量之间的相互关系。列线图的基本原理，简单的说，就是通过构建多因素回归模型(常用的回归模型，例如Cox回归、Logisti...
>f<-psm(Surv(time,status)~age+sex,data=pbc,dist='lognormal')>nom<-nomogram(f,lp=F)>plot(nom) 效果图如下 可以看到,LInear Predictor这个轴就不显示了。对于生存模型,我们希望通过该模型预测患者的生存时间和生存概率,基础的列线图显然并没有这样的信息,为此,我们需要自己写函数来添加我们想要的轴,用法...
转自个人微信公众号【Memo_Cleon】的统计学习笔记:生存资料(参数、半参数)预测模型的列线图绘制。 列线图(Alignment Diagram),也称诺莫图(Nomogram),绝是临床预测模型最为常见的一种呈现形式。列线图可以根据受试者的一些特征(解释变量)来预测结局事件的发生概率或者患者的生存率等。生存资料预测模型的列线图除了可以...
列线图(Alignment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图),用来把多因素回归分析结果(logistic回归和cox回归)用图形方式表现出来,将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,按照一定的比例绘制在同一平面上,从而用以表达预测模型中各个变量之间的相互关系。 根据模型中各个影响因素对结局变量的贡献程度(回归系数的大小),给...
列线图(Aligmment Diagram),又称诺莫图(Nomogram图),用来把多因素回归分析结果(logistic回归和cox回归)用图形方式表现出来,将多个预测指标进行整合,然后采用带有刻度的线段,按照一定的比例绘制在同一平面上,从而用以表达预测模型中各个变量之间的相互关系。
使用模型预测的概率作为X轴数据。使用实际观察到的结局概率作为Y轴数据。绘制校准曲线：X轴表示诺莫图预测的概率。Y轴表示实际概率。绘制一条表示完美预测的绿色虚线。绘制红色虚线表示整个队列的预测与实际概率的关系。使用Bootstrapping方法进行偏差校正，绘制蓝色实线表示观察到的诺莫图性能。三、评估模型预测...
绘制列线图我们主要用到以下两个R包。 if(!require("survival")) install.packages("survival")if(!require("rms")) install.packages("rms")library("survminer")library("rms") 2.完成前期准备工作 在绘制列线图之前必须要完成数据的导入与拆分,以及预测因子的筛选,列线图的构建只用到了训练集,这里大家需要...
列线图（Nomogram）是是一种图形化工具，用于简化复杂计算和统计模型的应用。它通过将多个变量的影响可视化，帮助用户直观地理解和应用统计模型，特别是在医学和生物统计领域。Nomogram 通常用于估计特定事件的概率或预测某个结果。在整理文献的时候，我们发现了一篇中国学者采用MIMIC-IV数据库发表的文章，文章使用的方法有...
通过上面的代码我们就可以将cph函数拟合出来的风险函数转换成生存函数，从而在列线图的绘制中我们可以规定显示具有临床意义的时间点的某个个体的生存概率。比如我想得到3年和6年的生存概率为结局的列线图，我就可以写出如下代码：plot(nomogram(f, fun=list(function(x) surv(3, x), function(x) surv(6, x...