分子识别是指两个或多个分子之间通过非共价键的特定相互作用,例如氢键、金属配位、疏水力、范德华力、π-π相互作用、卤素键或共振相互作用效应。除了这些直接相互作用之外,溶剂还可以在驱动溶液中的分子识别方面发挥主要的间接作用。参与分子识别的主客体表现出分子互补性。例外是分子容器,包括例如纳米管,其中入口基本...
2.超分子的重要特性——分子识别(1)“杯酚”分离C60和C70①原理:将 C_(60) 和C70的混合物加入一种空腔大小_适配C60的“杯酚”中,“杯酚”像个碗似的把Co装起来而不能装下C70。②流程示意图:C70C60+C70+超甲苯,过滤C70循环使用溶于甲苯氯仿C60溶于氯仿超分子不溶于甲苯C60不溶于氯仿(2)冠醚识别碱金属...
前半部分考虑了分子识别的物理基础,并讨论了不同的评分函数,这些函数都试图解释参与蛋白质配体识别的力。 Overview of Docking Applications 第一个对接程序直接跟随交互式分子图形程序的开发,该程序允许研究人员操纵两个分子,以找到在几何和化学上看起来互补的不同构型。分子对接程序允许自动搜索和更客观的方法来评估两...
半柔性对接是药物筛选过程中常用的一种方法,在对接过程中,靶点分子构象不变,配体分子构象在一定范围内发生变化。该方法适合于大分子和小分子化合物之间的对接计算。其计算量较小,速度较快。 (3)柔性对接 靶点分子和配体分子在对接时构象均可发生变化。该对接方法计...
它通常由两个部分组成:一个是分子编码器,它将分子结构编码为固定长度的分子表示,另一个是基于分子表示来预测某一性质的活性值的预测器。 少样本学习的目标是从有限数量的标记数据中进行推广。这些方法在性质预测任务中表现为从一组属性预测任务中预测分子属性,并推广到预测给定少数标记分子的新属性。由于分子可以自然...
在这项工作中,作者提出了一种基于分而治之的策略从分子图像中提取化学结构的深度学习方法。遵循分而治之的思想,文章把化学结构识别问题转化为原子和键检测问题。具体操作中用它们中心的单个像素点来表示原子和键,并利用关键点估计方法来检测它们。基于此,本文开发了一个称为 ABC-Net 的全连接卷积神经网络来预测所有...
分子识别技术的原理基于分子间作用力的相互作用。这些作用力可以是静电相互作用、范德华力、氢键等。分子识别技术的关键在于如何利用这些相互作用,从大量的分子中准确地识别、分离出目标分子。 分子识别技术的一种常见方法是利用亲和性分离。亲和性分离是指利用某种分子与目标分子之间的特异性相互作用,在样品中分离出目标分...
第一章 分子识别 分子识别的定义 主-客体的互补性和预组织性 热力学和动力学选择性 超分子相互作用的本质 分子主体的设计 本章主要内容 ※ 分子识别是主体(受体)对客体(底物)选择性结合并产生某种特定功能的过程 1.1 分子识别 超分子化合物中的组分:主体和客体,或受体和底物 主体(host)+客体(guest) 复合物(...
TAAR1中的第二个胞外环(ECL2)形成较特殊的“盖子”结构,并利用与其他单胺类受体差异较大的第186位苯丙氨酸以及其他疏水氨基酸直接或间接参与配体相互作用,形成TAAR1特有的分子识别机制(图2a)。与内源配体β-PEA相比,METH与关键残基第103位的天冬氨酸和107位的丝氨酸的极性相互作用较弱,导致其与TAAR1的亲和力下降...
与此同时，邵振华/颜微/孙金鹏/于晓联合团队的研究则聚焦于 TAAR1 对配体药物的识别机制，并基于药物分子的构效关系，筛选了一系列新的能够激活 TAAR1 的配体小分子。研究基于生物发光共振能量转移实验 ( BRET ) 、冷冻电镜以及多种生化与细胞生物学实验，测定了多种内源性生物胺（ β-PEA、T1AM、TMA、CAD 和...