仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “分子模拟构象作图” 改了，以后务必注意 注意VMD绘制第一张图时需要开启光线追踪 北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里深入讲VMD时的绘制例子，和你
图形如下
从2D 分子图中预测稳定的 3D 构象一直是计算化学中的一个长期挑战。而最近,机器学习方法取得了相比传统的实验和基于物理的模拟方法更优异的成绩。这些方法主要侧重于模拟分子图上相邻原子之间的局部相互作用,而…
研究人员识别出一系列此前未被观察到的中间态,为解释dynein-1的工作机制提供了大量新的见解,包括揭示了磷酸释放过程中的“分子后门(molecular backdoor)”机制,杠杆臂构象调控与步态机制的偶联,清晰展示了dynein-1如何将ATP的化学能转化为机...
理解和操控分子在不同溶剂环境中的动态行为,是药物发现和有机合成领域中的重要研究方向。分子动力学(MD)模拟通过显式地加入溶剂分子,被认为是在给定力场精度下计算这类构象集合的“金标准”,它能够补充实验发现并支持对实验结果的解释。然而,传统方法往往面临计算成本高(显式溶剂)或精度不高(隐式溶剂)的问题。该研...
可能的解释是:极性溶剂破坏了将杯芳烃骨架维系成“锥式”构象的分子内氢键作用。对于杯[6]芳烃,在构象上的一些折叠使羟基分为两组,每组四个羟基形成氢键网。杯[6]芳烃有较大环系,它们的构象间转换的自由度相对较大,易形成较多构象。 最常见的稳定构象的方法是在杯芳烃的下缘羟基上引入较大尺寸的取代基。通常...
一、什么叫做高分子的构型,什么叫做高分子的构象;试讨论线形聚异戊二烯可能有哪些不同的构型,并画出结构示意图(假定不考虑键接结构)。(10分) 相关知识点: 试题来源: 解析 解:聚异戊二烯可能有6种有规立构体,它们是: 常见错误分析:本题常见的错误如下: (1)将1,2加成与3,4加成写反了。 按IUPAC有机命名法...
第一章总结 树形图 结构单元的化学组 成 旋光异构 化学组成,构型, 构造和共聚物的 高分子链的构型 几何异构 链接异构 序列结构 高分 分子构造 一维,二维,三维高分子 子 链的结 无归,交替,接枝和嵌 段共聚物 构 共聚物的序列结构 生物高分子的序列 结构 构象 研究高分子链结构的 主要方法 红外与拉曼光谱 核磁...
如题，求问如何画例如10 3螺旋或者 31 螺旋的高分子链构象图。跪谢了@！！！使用diamond或者chem3D...
如题，求问如何使用diamond画 分子链螺旋构象图……