分子数据库是指存储和管理分子结构、化学信息和相关实验数据的电子数据库。它通常包含大量的化合物和化学反应的信息,这些信息可以用于药物研发、化学生物学和材料科学等领域的研究。分子数据库的目的是为科学家和研究人员提供方便快捷的访问和分析化学数据的工具。 2. 分子数据库有哪些常见的用途? 分子数据库在化
HPRD全称Human Protein Reference Database, 是一个专门存储人类蛋白质相互作用信息的数据库,和其他同类数据库相比,HPRD中的所有信息都是由阅读、解释和分析已发表数据的专家生物学家从文献中手动提取的,该数据库中存储的蛋白质互作信息都是经过实验验证的,而且数量上有明显优势。 除了数据质量和数量上的优势,HPRD还提...
●TCM-Mesh-中药制剂网络药理学分析的数据库和分析系统 ●CPMCP:一个中成药和复方数据库 ●TCMID 2.0:中药综合资源数据库 ●TCMSID:用于中药复方简化及中药成分信息检索的数据库 ●TCM2COVID/TCM-Suite数据库 ●LTM-TCM:在分子和表型水平上连接传统中医和现代医学的综合数据库 ●Horticulture Research | TCMPG:中...
三大分子数据库是PubChem、ChemSpider、和DrugBank。PubChem是由美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供的一个公共数据库,包含有机化合物和生物活性化合物的信息。ChemSpider由英国皇家化学学会(RSC)运营,旨在提供高质量、经过验证的化学信息,并且整合了来自多个来源的数据。DrugBank则是一个结合了详细的药物化学、药理学和药效...
“SMIfp”:大型有机分子数据库虚拟筛选&可视化分析 AIDDPro 2022-02-15 07:09:55 免费咨询 化学空间的探索,是近年来化学学科和计算学科不断研究和开发的重点工程,SMIfp(SMILES指纹)通过创建SMILES字符串中34个不同符号的出现频率,创建了一个34维的化学空间,并通过与大型分子数据库的串联,形成了化学空间成分分析的...
分子数据库记录包括两部分: 1.原始序列数据 2.生物信息注释 随着研究的积累,生物信息数 据越来越多。 为了研究的便利,能够对数据 进行存储共享和使用,所以分 子数据库应运而生。 派言派语 分子数据库有很多种,主要可以分为三大类:核酸数据库、蛋白质数据库、...
1、NCBI数据库 NCBI(美国国家生物技术信息中心)由美国国立卫生研究员(NIH)于1988年创办,创办NCBI的初衷是为了给分子生物学家提供一个信息储存和处理的系统,随着数据库各种资源的涌现,现在已经成为科研工作者的辅助工具了。通过这一数据库,我们可以获取某一基因的核酸或蛋白质序列。
三大分子数据库是指PubChem、ChEMBL和Protein Data Bank(PDB),其中,PubChem特别值得注意,因为它是由美国国立卫生研究院(NIH)的国家生物技术信息中心(NCBI)维护的,并且它提供了详细的数据关于各种小分子及其生物活性。PubChem不仅具有庞大的化合物数据库,还包括生物试验数据和化学结构的全面信息。ChEMBL由欧洲分子生物学...
化学空间的探索,是近年来化学学科和计算学科不断研究和开发的重点工程,SMIfp(SMILES指纹)通过创建SMILES字符串中34个不同符号的出现频率,创建了一个34维的化学空间,并通过与大型分子数据库的串联,形成了化学空间成分分析的可视化,为分子发现提供了一个思路和方法。
小分子数据库 一、公共数据库 1.ZINC http://zinc15.docking.org/ 2.PubChem https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/ 3.DrugBank https://www.drugbank.ca/ 4.ChEMBL https://www.ebi.ac.uk/chembl/ 5.ChemDB http://cdb.ics.uci.edu/ 6.HMDB http://www.hmdb.ca/...