在开始蛋白-分子的互作分析前,我们当然需要一个蛋白-分子结合文件图,即一个PDB文件。通常,在使用软件完成蛋白-分子对接后,我就能利用对应的软件去提取蛋白-分子结合的文件,即PDB文件。不同的软件有不同的方法。 以Autodock-Vina为例。 PTGS2.pdb:原始的受体蛋白,包含了这个晶体自带的配体。 PTGS2.pdbqt:受体蛋白...