(一)概念:在受体三维结构已知的基础上,通过受体和药物分子之间的几何匹配和能量匹配而相互识别的过程。 (二)原理:分子对接是将已知三维结构数据库中的分子逐一放在靶标分子的活性位点处。通过不断优化受体化合物的位置、构象、分子内部可旋转键的二面角和受体的氨基酸残基侧链和骨架,并预测其结合模式、亲和力和通过打分...
分子对接概念 分子对接(Molecular docking)是一种计算化学方法,用于模拟分子之间的结合和相互作用。它被广泛应用于药物发现、生物化学研究和蛋白质-配体结合等领域。 分子对接的主要目的是预测一个小分子(即“配体”)与一个大分子(即“靶标”)的结合方式,以及在这种结合方式下它们之间的相互作用。这种方法通过计算配体...
分子对接呢,就是让两个分子像拼图块一样凑到一块儿。比如说一种药和身体里的某个蛋白质分子。科学家就想让这个药分子和蛋白质分子能准确地对接上。如果对接得好,这个药就能发挥作用,治好病。 想象一下,这两个分子在一个微观世界里,左晃晃右晃晃,找着那个最合适的位置。就跟咱玩拼图的时候,这儿试试那儿试试...
同源配体:结合在晶体结构或阳性对照对接实验中使用的其他结构中的配体。 DNA编码文库(DEL):通过将化学化合物或构件与短DNA片段缀合来合成和筛选大量小分子化合物的技术,该短DNA片段可通过PCR扩增用作识别条形码。要了解更多信息,请阅读DEL Wikipedia页面,该页面写得很好。
同源分子对接 同源分子对接（homology docking）是2018年公布的生物物理学名词。定义 依据已知一个分子的三维结构以及另一分子的一级序列和与其同源的分子结构，需要先模建后一分子的结构，然后才能进行对接的方法。出处 《生物物理学名词》第二版。
自由态分子对接 自由态分子对接（unbound docking）是2018年公布的生物物理学名词。定义 起始于复合物形成前的两个分子的单体结构的对接方法。出处 《生物物理学名词》第二版。
六、关于分子对接进程中,活性位点的概念,下面说法正确的选项是: A. 若是受体结构中带有小分子配体,可参考小分子配体概念 B. 可依如实验中识别的关键残基概念 C. 可用
组合分子对接 组合分子对接（combinatorial docking）是2014年公布的药学名词。定义 一种新的分子对接策略，核心技术为对组合库分子对接时，先将库化合物过滤出共有的中心结构并在受体结合口袋优先定位，再添加各取代基进行对接和筛选，从而可以比逐一对接法大大减少计算时间。出处 《药学名词》 (第二版)。