荧光共定位分析(colocalization),是一种重要的荧光分析方法。 它的本质其实就是分析不同荧光标记的蛋白(这两种荧光必须有独立的发射波长),在空间中的重叠,从而判断这两种蛋白是否处于同一区域,即在同一像素上是否“恰巧”出现了两种不同的荧光分子。 共定位分析能间接地说明两个蛋白与同一结构有联系,但不是两种蛋白有相互作用的直接证
1.共定位分析是在一个基因组区域进行,所以至少一个数据里有CHR,BP,方便提取区域的SNP 2.共定位需要的是方差,而不是标准差,方差等于SE的平方,VAR = SE^2 3.共定位分析要求不能有重复SNP,并且SNP在两个数据中不能有缺失值 4.数据最好对齐效应等位基因 关于区域的选择:一般这个区域在1MB左右即可,这样保证区域...
激光扫描共聚焦显微镜在生命医学研究中广泛应用,通过共聚焦显微镜获取的图片可进行共定位分析。生物学上荧光共定位(Colocalization)指两个或多个不同分子位于细胞中的同一结构,常用来研… 酸菜发表于解螺旋 ImageJ实用技巧——荧光共定位分析(定量分析篇) Treasure琛 看完这篇,荧光共定位分析就没问题了! 老司机带你解...
逻辑疏导:共定位分析与其字面意思一样,就是找到共同作用的位置。全基因组关联分析(GWAS)是找到疾病相关的单核苷酸多态性位点(SNP),eQTL/pQTL等是找到与基因或者蛋白表达数量性状相关的SNP,两种分析的载体都是SNP,而基因或者蛋白又是处于中心法则,是形成疾病的必然过程...
目前GWAS的研究铺天盖地,在此基础上,大家为了接近临床意义,或者揭示疾病间相关性,提出了meta分析,孟德尔随机化,WGCNA, 以及类似本文的基于GWAS summary 数据的共定位分析。 数据类型 可以为个体基因型数据,或者GWAS summary数据 目的 此处提出四个假设,也就是最后得到结果时,需要的读懂的五个参数,PP0=无关联,PP1=...
ImageJ中的荧光共定位分析在生物研究中起着关键作用，它通过对比不同荧光标记蛋白的空间分布，判断它们是否在同一个区域。这种方法虽能暗示关联，但并非直接证据。比如，科学信号（Science Signaling）上的一篇文章就应用了此技术来验证NPY-pH蛋白在特定囊泡中的定位。定量分析荧光共定位在ImageJ中操作相对...
中，荧光共定位技术被用于研究异常蛋白（如β-淀粉样蛋白和tau蛋白）的聚集及其与细胞器的相互作用。例如，通过共定位分析可以发现β-淀粉样蛋白与线粒体的共定位程度升高，提示线粒体功能障碍可能是疾病进展的关键因素。 在病毒感染研究中，共定位技术能够揭示病毒蛋白与宿主细胞结构的相互作用。例如，新冠...
Plot Profile进行共定位分析的缺点是不能对共定位进行定量描述,因此需要进行进一步的定量分析。 2. 荧光共定位定量分析方法 (1)Colocalization Finder插件分析共定位 下载链接:https://imagej.nih.gov/ij/plugins/colocalization-finder.html,安装方法与ScatterJ...
二、共定位分析方法 1.使用ImageJ的Plot Profile工具：打开需要分析的荧光图片。将各荧光通道分开。将多幅图像变成图像栈。选定图像栈中感兴趣的区域，使用Plot Profile工具进行分析。弹出的图像中，横轴代表线上各像素点，纵轴为各点对应的灰度值，图像代表了灰度的变化趋势。对比各通道结果图可以大致了解共定位情况。...
mr共定位分析流程 样本准备阶段,实验材料需提前处理。细胞或组织样本固定后,选择合适荧光标记物,避免光谱重叠干扰。标记物浓度根据预实验结果调整,过高导致信号溢出,过低影响成像质量。固定时间过长可能破坏抗原表位,建议参考同类研究优化条件。 仪器校准环节,共聚焦显微镜开机预热30分钟确保激光稳定。设置激发波长与发射波长...