导言：全蛋白质组关联研究（Proteome-Wide Association Study, PWAS）是一种检测蛋白质功能改变介导的基因表型关联的新方法。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 近日，艾默里大学的一个研究团队通过收集阿尔茨海默氏病（AD）患者的基因组学和死后...
在此背景下,来自美国埃默里大学的研究人员于2021年4月12日在Nature Neuroscience上发文,通过将抑郁症全基因组关联分析(GWAS)结果与人脑蛋白质组进行整合,进行全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study,PWAS),以期通过鉴定抑郁症中潜在的病因脑蛋白作为治疗抑郁症的潜在靶标。 1.抑郁症的PWAS研究 PWAS是一种...
4、PWAS结果不受APOE e4影响 载脂蛋白APOE e4等位基因与阿尔茨海默症密切相关,因此作者为了探究APOE e4是否影响了PWAS结果,从蛋白质组中去除掉APOE e4的作用,使用去除后的蛋白质组图谱进行了AD PWAS。分析发现了13个与发现阶段PWAS结果一致的重要基因和6个其他基因,且所有13个基因都具有与发现阶段PWAS中相同的关...
使用从肾脏功能和损伤的相应源GWAS中提取的最显著的区域关联,168个性状-区域关联达到了标准的共变GWAS阈值(P值<5×10-8),28个性状-区域关联仅通过TWAS/PWAS检测,没有达到GWAS显著性(即GWAS P值>5×10- 8)。这些新的关联是通过...
导言:全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study, PWAS)是一种检测蛋白质功能改变介导的基因表型关联的新方法。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 近日,艾...
全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study, PWAS)是一种检测蛋白质功能改变介导的基因表型关联的新方法。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 近日,艾默里大学的一个研究团队通过收集阿尔茨海默氏病(AD)患者的基因组学和死后大脑蛋白质...
导言:全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study, PWAS)是一种检测蛋白质功能改变介导的基因表型关联的新方法。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 近日,艾默里大学的一个研究团队通过收集阿尔茨海默氏病(AD)患者的基因组学和死后大脑...
全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study, PWAS)通过蛋白质的功能变化将基因和表型联系起来 ， 是一种新型的以蛋白质为中心的遗传关联研究方法，在人类遗传学研究领域具有广泛的应用前景。2021年1月28日，国际学术期刊Nature Genetics(IF=27.603)上报道了来自埃默里大学医学院题为“Integrating ...
导言:全蛋白质组关联研究(Proteome-Wide Association Study, PWAS)是一种检测蛋白质功能改变介导的基因表型关联的新方法。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。 近日,艾默里大学的一个研究团队通过收集阿尔茨海默氏病(AD)患者的基因组学和死后大脑...
1.Manhattan 图用于发现 AD PWAS PWAS鉴定了13个基因,其顺式调节的脑蛋白水平与AD相关,错误发现率(FDR)为P<0.05。 这13种蛋白质中的10种可以测试,所有10种蛋白质都可以在确认PWAS中复制(表1)。 2.发现AD-PWAS的13个重要基因的COLOC和SMR分析 使用贝叶斯共定位方法COLOC检验了13个发现的AD-PWAS重要基因蛋白质...