全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS)是研究动植物复杂性状的重要手段。通过对自然群体具有丰富遗传多样性的每个个体进行全基因组重测序,结合准确的目标性状的表型数据及统计方法进行全基因组分子标记与性状之间的关联分析,可快速获得影响目标性状表型变异的遗传标记或候选基因。
全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),是指对遗传多样性丰富的群体进行全基因组大样本重测序,在全基因组范围内找出存在的序列变异,即单核苷酸多态性(SNP),通过各种统计分析方法,从中筛选出与性状相关的 SNPs。GWAS 可快速准确地实现多个目标性状基因的高效定位,进一步获得与这些性状关联的候选基因或...
全基因组关联分析(Genome-wide association study,简称GWAS)是一种在群体水平研究表型-基因型关系的研究策略。GWAS是在特定群体中检测全基因组水平数以百万计的分子标记(例如SNP标记、CNV标记)基因型信息的基础上,开展群体中个体表型与基因型的相关性分析,从而解析影响复杂性状的基因变异。随着测序价格的不断下降,全基因...
全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状,即表型,进行群体水平的统计学分析,根据统计量或显著性 p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异(标记),挖掘与性状变异相关的基因。 image.png 相对于连锁分...
genome-wide association study; GWAS 所属学科 现代医学 随着人类基因组计划及国际人类基因组单体型图计划(HapMap)的完成,许多高通量技术和分析方法的完善,使得全基因组关联分析(GWAS)研究成为可能。自2005年,权威杂志《科学》(Science)报道利用GWAS第一次成功鉴定了影响年龄相关性视网膜黄斑性病变的遗传因子后,世界各国...
全基因组关联分析(Genome-Wide Association Analysis Study, GWAS)作为一种有效的手段已经被用来研究宿主和微生物组之间的关 系.本文基于国内外最新研究进展,从以下方面进行综述,包括植物对微生物组的调控,以及如何应用 GWAS 研究植物与微生物 组互作遗传机制,重点阐述了植物与微生物组关联分析中微生物组作为"拓展表型...
1 GWAS概述 全基因组关联分析(genome-wide association study, GWAS)是一种通过检验全基因组遗传标记与表型变异关联的显著性来定位与性状相关的遗传位点, 在群体水平上解析性状遗传基础的方法。影响GWAS的关键因素之一是群体水平存在连锁不平衡(linkage disequilibrium, LD)。重组是打断LD的主要因素(Visscher et al.,...
全基因组关联分析(Genome wide association study,GWAS)是对多个个体在全基因组范围的遗传变异(标记)多态性进行检测,获得基因型,进而将基因型与可观测的性状,即表型,进行群体水平的统计学分析,根据统计量或显著性 p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异(标记),挖掘与性状变异相关的基因。 相对于连锁分析的优势 ...
全基因组关联分析(genomewide associationstudy,GWAS)是应用人类基因组中数以百万计的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)为标记进行病例一对照关联分析,以期发现影响复杂性疾病发生的遗传特征的一种新策略.近年来,随着人类基因组计划和基因组单倍体图谱计划的实施,人们已通过GWAS方法发现并鉴定了大量与...