网站分为四个教程:1)GWAS的数据QC; 2)处理群体分层;3)关联分析(GWAS); 4)多基因风险得分分析(Polygenic risk score analyses) 「示例数据都有了,就等你自己上手了。」 「我敢保证,当你能完整的跑完这个流程的时候,你对GWAS的理解少说也有70% ,下一个在群里帮我解答问题的大神就是你了(申请进群方式见公...
GWAS群体分层 (Population stratification):利用plink对基因型进行PCA EIGENSTRAT除了用来计算PCA,还可以干嘛 群体遗传分析分层校正,该选用多少个PCA? 3.3.3 关联分析 GWAS: 曼哈顿图,QQ plot 图,膨胀系数( manhattan、Genomic Inflation Factor) 想要高级感的曼哈顿图 对曼哈顿图(Manhattan plot )多个显著位点标志不同颜...
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全基因组关联分析学习资料(GWAS tutorial)20210313更新版 时隔一年多,于今日(20210313)再次更新教程,后续如果新出教程的话会一直更新。 同时感谢多年陪伴我成长、一直默默关注我的「你们」~ by「橙子牛奶糖(陈文燕)」 1.前言 很多人问我有没有关于全基因组关联分析(GWAS)原理的书籍或者文章推荐。
网址:https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 网站分为四个教程:1)GWAS的数据QC; 2)处理群体分层; 3)关联分析(GWAS); 4)多基因风险得分分析(Polygenic risk score analyses) 示例数据都有了,就等你自己上手了。 我敢保证,当你能完整的跑完这个流程的时候,你对GWAS的理解少说也有70% ,下一个在群里...
网址:https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/ 网站分为四个教程:1)GWAS的数据QC; 2)处理群体分层; 3)关联分析(GWAS); 4)多基因风险得分分析(Polygenic risk score analyses) 示例数据都有了,就等你自己上手了。 我敢保证,当你能完整的跑完这个流程的时候,你对GWAS的理解少说也有70% ,下一个在群里...
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