T细胞克隆扩增能力:免疫治疗是否成功激活特定T细胞亚群? 此前的研究主要聚焦于单一癌种,而本研究的亮点 在于:首次在泛癌种水平系统分析ICB响应的T细胞特征,并构建泛癌种ICB疗效预测模型。 研究核心发现:哪些T细胞决定ICB疗效? 研究基于单细胞RNA测序(scRNA-seq) 和TCR测序(scTCR-seq),发现了四类与ICB疗效显著相
研究者们通过整合单细胞RNA测序、染色质可及性、空间转录组学和胶质瘤类器官系统,发现了四种免疫调节表达程序:微胶质炎症和清道夫免疫抑制程序,这两者是原发性脑肿瘤所特有的;以及系统性炎症和补体免疫抑制程序,这两者也在非脑肿瘤中表达。...
发现在TCGA数据集中对生存没影响,在另一个免疫治疗数据集中可以区分生存。因此作者认为,浆细胞signature对免疫治疗后响应预测价值不局限于非小细胞肺癌。 将综合生存(OS)这个评价标准换为objective responses,同样可以得到类似的结果。在免疫治疗组,浆细胞signature T3比T1-2中有更多的CR/PR/SD比率。 在不同的分组体系...
综合而言,该研究揭示了接受基于 ICI 的治疗的 PLC 患者的动态免疫景观,有助于 PLC 患者分层以进行基于 ICI 的治疗,并促进新的反应监测策略。 创新点: 首次采用单细胞规模质谱流式细胞术深入分析原发性肝癌患者免疫检查点抑制剂治疗的动态免疫景观 创新性地构建了基于外周血单核细胞免疫谱系的ICI治疗应答预测模型 揭...
STEP5:开发与患者对抗pd -1治疗的反应相关的MHC I相关免疫评分 在文章的最后,作者开发并验证了可以用来预测癌症患者对抗pd1治疗响应的signature。并与其他三种最近提出的方法(IMPRES、TIDE和GEP)进行了比较,进一步验证了其预测性能的优越性。 总结 (1)本文也延续了高分文章的一贯作风:不仅提供潜在的靶点,还提供潜在的...
皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)是一种罕见的侵袭性肿瘤,但目前皮肤T细胞淋巴瘤患者的免疫治疗响应率仅有38%,传统方法无法有效预测免疫治疗的效果,因此我们需要一种全新的生物标志物作为皮肤T细胞淋巴瘤的预后方法。 来自斯坦福大学医学院和哈佛医学院的研究团队在《Nat Commun》(IF=16.6)发表的一项题为“Immune cell to...
基因组与免疫特征:高风险组TTN突变率达57%,且TMB水平更高(p=0.013)。低风险组免疫检查点(CD80/CTLA4)表达升高,IPS评分提示其对PD-1抑制剂更敏感(p<0.001)。 治疗响应预测:qRT-PCR验证PPP1R14B-AS1在LUAD细胞中普遍上调(16HBE vs A549:4.2倍)。药敏分析显示高风险组对Gemcitabine的IC50降低38.7%(p=0.004)...
首先，4种TME分型在24种肿瘤类型中都存在，TME分型对于临床预后的预测在泛癌水平和单个癌症类型中都存在，说明4种TME分型具有保守性。其次，4种TME分型与免疫治疗具有相关性。例如anti-CTLA-4免疫治疗中，IE型皮肤黑色素瘤患者对治疗的响应比例是82%，而F型是10%；IE型OS最长。然后对免疫治疗前后进行分析，可...
检查点受体对于防止过度免疫反应和自身免疫反应至关重要。l大量实验证明阻断免疫检查点信号产生明显的抗肿瘤免疫反应。 非小细胞肺癌(NSCLC)患者可以通过使用抗体抑制 PD-L1和 CTLA-4获益,然而,简单而有效的预测 ICI 治疗反应的生物标志物...
本研究针对甲状腺癌(THCA)干细胞特性(CSCs)与免疫治疗响应机制不明的关键问题,通过整合13个转录组数据集和CRISPR筛选数据,鉴定出26个癌症干性相关mRNAs,构建了基于随机森林算法(RSF)的肿瘤干细胞评分模型(TSC)。该模型成功预测了CTLA4抑制剂疗效和患者预后,并发现染色体1q扩增基因CKS1B通过激活STAT3/AKT通路促进THCA进...