PLS是偏最小二乘分析,DA是判别分析。再加一个o就是加了一个正交,OPLS-DA就是正交偏最小二乘法判别分析。 当变量数量远大于样品数量时(行数小于列数), PLS或 PLS-DA模型容易过拟合,但是PCA效果也不好。但是加入正交矫正之后数据检出假阳性会降低,所以会更准确。数据处理的时候一般是先做PCA,然后做OPLS-DA。
R包ropls的PCA、PLS-DA和OPLS-DA 在代谢组学分析中经常可以见到主成分分析(PCA)、偏最小二乘判别分析(partial least-squares discrimination analysis,PLS-DA)、正交偏最小二乘判别分析(orthogonal partial least-squares discrimination analysis,OPLS-DA)等分析方法,目的为区分样本差异,或在海量数据中挖掘潜在标志物。
df<-unclass(df_plsda)#提取坐标值df1=as.data.frame(df$variates$X)df1$group=group$groupdf1$samples=rownames(df1)#提取解释度explain=df$prop_expl_var$Xx_lable<-round(explain[1],digits=3)y_lable<-round(explain[2],digits=3)#绘图col=c("#1597A5","#FFC24B","#FEB3AE")p1<-ggplot(df1,...
偏最小二乘法判别分析(pls-da ,Partial least squares discrimination analysis) 偏最小二乘法判别分析原理: 偏最小二乘法判别分析是一种用于判别分析的多变量统计分析方法。判别分析是一种根据观察或测量到的若干变量值,来判断研究对象如何分类的常用统计分析方法。其原理是对不同处理样本(如观测样本、对照样本)的...
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在代谢组学分析中, PLS-DA (偏最小二乘判别分析分析)是一种有监督方法,需要事先确定样品所属的类别。A.正确B.错误的答案是什么.用刷刷题APP,拍照搜索答疑.刷刷题(shuashuati.com)是专业的大学职业搜题找答案,刷题练习的工具.一键将文档转化为在线题库手机刷题,以提高学习效
1) partial least squares discriminant analysis(PLS-DA) 偏最小二乘法判别分析 2) ginsenoside 偏最小二乘法-判别分析 3) PLS 偏最小二乘 1. PLSestimation and application of the fixed effect of panel data model s parameters; 固定影响平行数据模型参数的偏最小二乘估计 ...
偏最小二乘法判别分析,即我常说的PLS-DA(Partial Least Squares Discriminant Analysis),经常被用来处理分类和判别问题。这种方法和PCA分析方法是比较类似的,区别在于二者是否有监督,一般PCA是无监督的,而PLS-DA是有监督的。 当碰到样本组间差异大而组内差异小的情况,常见的PCA分析方...
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