H4R3me2a还可促进其他组蛋白修饰来募集参与转录调控的染色质修饰酶。H4R3me2a可诱导H4K5和H4K12乙酰化,使转录起始因子TAFⅡ250募集,从而有助于染色质开放,促进基因转录。此外,一种已知的H3K9me2去甲基化酶JMJD1B也被证明可有效使H4R3me1和H4R3me2a去甲基化[16]。以上即是目前较为常见且已有一定研究的组蛋...
此外,组蛋白甲基化类型也有很多种,包括赖氨酸甲基化位点H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79 和 H4K20等,精氨酸甲基化位点H3R2、H3R8、H3R17、H3R26和H4R3等。今天将针对这些相对常见的修饰位点做简单的介绍。 1、H3K4 H3K4甲基化在进化上是保守的,可标记具有转录活性的基因组区域。H3K4me1在增强子上高度富集,...
此外,组蛋白甲基化类型也有很多种,包括赖氨酸甲基化位点H3K4、H3K9、H3K27、H3K36、H3K79 和 H4K20等,精氨酸甲基化位点H3R2、H3R8、H3R17、H3R26和H4R3等。今天将针对这些相对常见的修饰位点做简单的介绍。 1、H3K4 H3K4甲基化在进化上是保守的,可标记具有转录活性的基因组区域。H3K4me1在增强子上高度富集,...
如何鉴定泛素修饰类型与靶蛋白修饰位点?一、泛素修饰类型鉴定。使用HA-Ub-WT/KO泛素修饰系统检测修饰类型:使用HA-Ub-WT和HA-Ub-KO(K6,K11,K27,K29,K33,K48和K63)载体,分别与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞,通过CoIP-WB检测底物泛素化水平,明确泛素连接酶对修饰底物的泛素修饰类型。或再次使用HA-Ub-WT...
使分子量发生114.1 Da的质量偏移。利用质谱检测分子量的偏移,从而鉴定乙酰化修饰肽段及位点。
质谱修饰位点的确定是指通过质谱分析技术来鉴定蛋白质中哪些氨基酸残基发生了修饰。 质谱修饰位点的确定通常包括以下几个步骤: 1. 蛋白质的制备:从细胞或组织中提取目标蛋白质,并通过蛋白质分离纯化技术(如凝胶电泳、液相色谱等)获得单一的蛋白质样品。 2. 蛋白质消化:使用胰蛋白酶等特定的消化酶对蛋白质进行酶解,...
m6A修饰是真核RNA中最丰富的共转录修饰,在细胞调控中发挥着重要作用。近日,《Briefings in Bioinformatics》发表了一种基于注意力的深度学习方法adaptive-m6A,用于识别多个物种中的m6A位点。 为什么要开发adaptive-m6A? 近年来,深度学习方法在不同领域以及RNA修饰预测中得到了广泛应用,但仍有一些局限性。首先,他们中的大...
1.完整N-糖肽蛋白质一站式多维分析,提供修饰组学研究更创新研究方案 完整N-糖肽蛋白组学仅通过一次实验,可同时分析糖链+修饰位点+修饰肽段+修饰蛋白, 实现糖基化研究多维度分析结果,一站式解析糖型、糖基化位点、糖基化肽段和蛋白。并且样本类型兼容性广泛,血浆、细胞、组织样本等均可友好适用。完整N-糖肽为...
泛素修饰类型和靶蛋白修饰位点如何鉴定泛素修饰类型和靶蛋白的修饰位点?1. 使用HA-Ub-WT/KO泛素修饰系统检测修饰类型步骤: HA-Ub-WT和HA-Ub-KO系统:使用HA标记的野生型泛素(HA-Ub-WT)和赖氨酸突变型泛素(HA-Ub-KO,如K6R、K11R、K27R等)载体,与泛素连接酶(E3)和修饰底物共转染细胞。
2785 -- 1:34 App 基于深度学习的RNA-蛋白质结合位点预测的网站--RBPsuite 6291 1 44:50 App 预测突变对蛋白质稳定性和结合的影响-Predicting Effect of Mutation on Protein Stability and Binding 734 -- 17:54 App 修饰位点+motif+激酶预测+差异分析+通路富集解读 信息...