20 进入Metabolites填写,可以点击upload上传可自动识别的txt(EXCEL打开进行编写)文件File:m_MTBLS2788_LC-MS___metabolite_profiling-1_v2_maf.tsv进行批量填写,这个文件可在这个网页上下载下来然后填写关键信息:metabolites identification 即代谢物名称、mass to charge即m/z、retention time (RT)、Modification即adduct...
干货:空间代谢组原始数据上传流程 #科研 #学习 #代谢组学 #科技,于2024年10月9日上线。西瓜视频为您提供高清视频,画面清晰、播放流畅,看丰富、高质量视频就上西瓜视频。
点击Create New Study创建研究登录号,之后MetaboLights会分配Study ID,此ID作为研究唯一登录号,并用于文章发表(通常一个代谢组学的项目对应一个Study,如果文章中包含多个代谢组学数据如非靶+靶向,需要创建多个Study) 网站会出现项目编号和网址链接(便于后续查看数据或撰写文章),之后点击“next” 有两个上传数据的方式可...
空间代谢组数据上传METASPACE的具体操作文字版，如下：1、METASPACE数据库简介 METASPACE是一个质谱成像数据进行代谢物注释的平台，可以用来上传空间代谢组数据。老师们可以创建一个简短的项目链接在稿件中使用，并在项目描述中添加摘要来描述项目概览。审稿人可使用审稿链接在不公开数据的情况下访问项目，有助于数据保密，并...
数据上传 前期的信息准备小小的告一段落,整体上看数据上传分为以下7个内容根据实际情况,进行逐一填写信息即可啦! 第一部分:填写descriptors中的关键词和factors(如剂量)等根据实际情况填写。 第二部分:填写protocols方法信息,包括样本收集、提取、色谱方法、质谱方法...
MetaboLights 是EMBL-EBI数据库的子数据库,该数据库是跨平台、跨物种的代谢组学研究通用、开放存取的数据库,其涵盖了代谢物结构、参考光谱、生物学作用以及来自代谢组实验数据等。MetaboLights是许多领先期刊的推荐代谢组学资料库。 1账号注册与登录 打开网址(https://www.ebi.ac.uk/metabolights/),注册MetaboLights帐户...
相对而言,上传普通的原始数据到NCBI,绝对是简单快捷。代谢组的数据需要上传到https://www.ebi.ac.uk/metabolights/,真的是非常困难。 先注册账户Create a new account (ebi.ac.uk),填写信息。 然后准备你需要上传到的代谢组的原始数据和表格, 这里是BMK公司测序的非靶向代谢组测序, ...
代谢组数据就可以上传到多元数据归档库(OMIX)。 如何上传代谢组数据 上传代谢组数据大致可以分为3个步骤: 第一步:进入NGDC主页,创建BioProject NGDC主页地址:https://ngdc.cncb.ac.cn/。进入后点"登录"注册账号。 使用邮箱注册,或者已经有账号的直接登录,具体注册过程就不介绍了。
代谢组数据上传发表文章的过程大致分为以下几个步骤: 第一步,根据研究的实际需要,采集代谢组数据,如血清、尿液、细胞培养液等,并使用专业的仪器装备进行检测,获得代谢组数据; 第二步,进行数据处理,包括数据清洗、数据聚类、数据标准化等,以获得有效的代谢组数据; 第三步,发表文章,将处理好的代谢组数据上传到相关文...
大家好,我想请教一下代谢组数据上传的问题。我是无法上传代谢物的注释信息,上传Metabolite annotation的文件不显示,不知道哪里出错了。手动输入的话有3000多个代谢物,很慢。网络找到的攻略具体的流程是⑰进入Metaboliteannotation填写,有两种方式:可以选择upload上传系统能够自动识别的txt文件File:m_MTBLS4669_LC-MS_posi...