关于代谢物信息的查询,大致可分为两种方式,通过代谢物相关网站查询、搜索文献查询,或者简单的物质可以直接百度查询。 一、通过代谢物相关网站查询 上次,我们介绍的METLIN、MassBank、mzCloud、HMDB、MetaCyc、Lipidmaps、MS-Dial以及NIST、Fiehn、GMD等代谢物鉴定数据库实际上也包含代谢物的一些信息。但由于数据库收录代谢...
肠道菌群自身也可合成代谢物如 (1) 支链氨基酸 (Branched-chain Amino Acid, BCAA)，可促进蛋白质合成并提供能量。(2) 多胺，能够与蛋白质、核酸类物质结合，调节细胞生长。(3) 维生素，在结肠被进一步利用[1]。这 3 类肠道菌群自身合成的物质，人体通过饮食也可获得。▐肠道菌群代谢物与肿瘤免疫 研究表明，7...
此外，2024年3月，Jonathan Z. Long 教授团队在 Nature Metabolism 期刊发表论文【3】，该研究发现，二甲双胍通过诱导Lac-Phe的产生来发挥降低食欲和减肥的作用，而Lac-Phe是在剧烈运动后产生的具有抑制食欲和减轻肥胖作用的小分子代谢物。该研究表明了二甲双胍与剧烈运动通过同一个途径来抑制食欲，这为新型减肥药物...
图中一行就代表一个差异代谢物,左半部分是散点图,横坐标为VIP值,VIP值越大在分组中的贡献度越高;右半部分是热图,和图B、图E含义一样,在每组中各样本代谢物丰度取均值后做z-score分析后的值,渐变色表示代谢物丰度高低,颜色越红相对丰度越高,颜色越蓝,相对丰度越低。 图2 基迪奥客户使用Omicsmart完成代谢组PL...
脑代谢物的绝对量化是非常复杂的。在临床实践中,由于肌酸(Cr)被认为是最稳定的代谢物,所以常选择它作为内部基准,评价代谢比率。为了便于分析,应该了解检出的代谢物的浓度,并且要了解随着采样区域的不同和患者年龄的差异,代谢物与肌酸的比率差异很大。 区域变化...
在拿到代谢物定量表格后,首要任务是寻找组间显著差异的代谢物有哪些,如最常用的比较组间:实验组(treat)VS对照组(control)。此部分代谢物是你的实验处理导致显著差异的,是最有研究价值的部分数据。那么差异代谢物是如何定义的?差异阈值标准又有哪些?每个阈值标准又涉及到哪些统计学分析方法?一、差异代谢物如何定义?我...
2022年2月，中国科学院研究团队在《Nature》子刊《Cell Discovery》上发表一篇长文，首次指出尿苷是延缓干细胞衰老、促进组织再生的关键代谢物。该研究首先确定了两种已知具有再生能力的动物组织——蝾螈肢体胚芽和鹿茸干细胞，对它们进行了转录组学和代谢组学分析，筛选了数十种代谢产物，最后发现尿苷在这些组织的再生功能...
随后研究人员在生酮饮食、24 小时禁食或口服酮酯饮料（3 克/公斤体重）1 周后，测量小鼠血浆中的 BHB- 氨基酸水平，发现其水平在这些条件下都是升高的，这再次证明 BHB- 氨基酸是内源性的，且是酮症诱导的小鼠代谢物。图 | 小鼠血浆中 BHB- 氨基酸的检测及酮症诱导性 为了直接测试 CNDP2 对 BHB- 氨基酸生物...
代谢物通过调控mTORC1的上游分子调节其活性，因此作者推测，FA合成过程中产生的代谢产物也可能直接或者间接调控mTORC1活性，以根据代谢产物的水平实现对mTORC1活性的反馈调节。研究策略：本文主要是作者根据前期研究发现酵母中FA合成的相关酶和Rag存在相互作用，而Rag对于mTOR的溶酶体定位和激活非常重要，因此猜测脂肪酸合成...
除了通过“KEGG PATHWAY”可以查询到物质信息,但是如果我们只是对某个物质感兴趣的话,我们也可以直接通过网站中的物质查询通道来进行查询获得物质信息。点击首页中的“KEGG COMPOUND”进入代谢物的专属页面后,在上方的搜索框中进行检索即可,可...