具体来说,已找到的草莓二倍体祖先物种通常在可靠的系统发育树中未充分分歧,在诸如此类的情况下,异源多倍体草莓某亚基因组与近缘的二倍体草莓(并不是该异源多倍体草莓的真实祖先亲本物种,而只是由于不完全谱系分选而与异源多倍体的某亚基因组聚在一起)聚在一起,这时系统发育的方法将无法确定亚基因组的真实祖先。一项未被充分利用的技术可能有助于解
网上的很多教程说的共线性分析,往往是指的基因的共线性分布情况,具体作图时依据基因的关联位置信息等,输入文件包括gff以及fasta等信息。 这里说的亚基因组共线性,是指两条序列或两个基因组间的一致性分布情况,只需要输入两条fasta或者两个基因组序列文件即可,主要目的是看序列间的相似性以及发现序列间的结构变异情况...
转录组分析发现,矮抗58中上调表达的基因数量较高。 图3、AK58与CS 的表型与基因组和转录组的比较。 亚基因组二倍化与分化、HGWAS及现代品种改良 研究发现,在六倍体小麦中由于亚基因组二倍化与分化,使得每个多倍体位点中三个亚基因组的直系同源基因(subgenomic orthologs, or homoeologs)通常显示出既有互补性又有...
析,分析杂种优势和遗传距离的关系,分析结果表明,在三年的种子产量性状上, 杂种优势和遗传距离都表现出显著的正相关,这说明对于甘蓝型油菜材料和核不育 材料之间的遗传距离是越大越好。 为了更清楚地了解亚基因组间杂种优势的遗传基础,应用529个DNA分子标记 ...
例略大于负效应。从遗传模式看,亚基因组间杂种优势遗传模式是上位性、显性和 超显性效应多种效应的综合作用。 甘蓝型油菜为异源多倍体,A和C基因组的高度相似性(同源基因)为杂种优 势固定的研究提供了有利条件。利用TH.RIL群体中检测的203个互作对来分析杂 ...
显性亚基因组复旦大学蛋白质组学与系统生物学研究所 蛋白质组学与系统生物学研究所将以疾病蛋白质组研究为主线,带动其他组学(如功能基因组、转录组、代谢组和生物信息学)研究,从而建立疾病系统生物学的研究高地。主要研究方向是人类肝脏的蛋白质组和肝脏疾病比较蛋白质组研究,以及基于所有组学和传统生物学的肝脏系统生...
亚基因组复旦大学蛋白质组学与系统生物学研究所 蛋白质组学与系统生物学研究所将以疾病蛋白质组研究为主线,带动其他组学(如功能基因组、转录组、代谢组和生物信息学)研究,从而建立疾病系统生物学的研究高地。主要研究方向是人类肝脏的蛋白质组和肝脏疾病比较蛋白质组研究,以及基于所有组学和传统生物学的肝脏系统生物学...
因此,本研究旨在通过综合方法来鉴定EHH,包括形态学评估、HPLC分析、比较质体基因组分析和等位基因特异性PCR鉴定。首先,总结了8种大戟亚属植物的形态特征。然后,HPLC分析显示18批EHH样品被掺假或不合格。此外,对这8种大戟亚属物种的质体基因组进行了分析。系统发育分析揭示了这8种大戟亚属物种之间的姐妹关系。通过单...
作者调查记录了215份亚洲棉幼苗期的侧根数量。相关性分析表明,侧根数量与果枝节位和籽指性状呈正相关,而与衣分性状呈负相关。全基因组关联研究 (GWAS) 挖掘出与侧根数相关的18个显著SNP信号并关联到19个候选基因。表达分析鉴定出3个基因(FLA12、WRKY29和RBOH...
中国药科大学李萍/陆续团队近期在《Food Chemistry》期刊发表了题为“Comparative plastomes of eight subgenusChamaesyceplants and system authentication of Euphorbiae Humifusae Herba”的研究论文,通过8种地锦草亚属植物的质体基因组比较分析对地锦草药材进行了系统鉴定。