生成的七棵树均显示出相同的系统发育拓扑结构(即[A,D],B),其中D亚基因组与A亚基因组关系最接近(如图S2所示)。因此,基于每个染色体的系统发育,分别分配了A和B亚基因组(如图1A和B所示),将亚基因组A分配为D的姐妹亚基因组,将亚基因组B分配为A + D枝的姐妹亚基因组。最后,使用分阶段亚基因组,我们重建了具有最大基因数的物种/亚基因组树
为蛋白质组亚型发现了潜在的治疗策略 Summary Para_01 胰腺中的大多数神经内分泌肿瘤是非功能性胰腺神经内分泌肿瘤(NF-PanNETs),其远处转移的发生率较高,且治疗选择有限。 在此,我们通过对基因组、转录组、蛋白质组和磷酸化蛋白质组数据进行综合分析,对108例NF-PanNETs进行了全面的分子特征研究。 蛋白质基因组...
Output关键信息提取:Consistent with subgenome assignment: 248 (91.85%); potential exchange: 10 (3.70%)。 即,经统计检验之后,对应亚基因组某些部分或许与phasing结果不同,可能存在染色体重排等。 5、亚基因组特征分析 Output信息如下: SubPhaser一些其他功能,即鉴定基因组中的哪些特征是在某一亚基因组中呈富集状态。
ccRCC患者通过无监督聚类算法被分为两个亚组:褪黑激素型癌症亚型1 (MPCS1)和亚型2 (MPCS2),然后在两种亚型之间进行功能富集分析、免疫浸润分析、基因组突变分析和药物敏感性分析。基于亚型特征,构建了一个褪黑素调节因子相关的预后模型RCC-MP6,并使用外部数据集进行了验证。最后筛选模型关键基因并进行验证。
北方汉人比南方汉人高出数倍的白人血统进一步拉开了遗传距离 | Northern Route.:来自Y染色体和线粒体DNA的遗传多样性数据以及最近的全基因组常染色体单核苷酸多态性表明,东南亚大陆是东亚人口的主要地理来源。但是,这些研究还发现了东亚中南亚(CSA)和/或西欧亚大陆(WE)的相关遗传成分,这暗示着最近的人口混杂或通过拟议...