首先利用 survival包中的Kaplan–Meier曲线方法评估不同亚型之间生存预后相关性,分析不同亚型之间的生存预后信息是具有显著差别,之后对基因表达水平在亚型样本中的分布进行热图绘制,最后整理样本临床信息(年龄、性别等),对亚型与样本的临床因素进行相关性分析;这就是小果今天带来的内容,在肿瘤生信文章中亚型相关分析出现的频率非常高,灰常值
然而,随着非负矩阵分解(nonnegative matrix factorization,简称NMF)技术在公开RNA测序(RNA-seq)数据分析中的广泛应用,SCLC亚型分析也取得了长足进展。将这些亚型带入IMpower133显示,CE联合使用阿替珠单抗,对SCLC-I亚型疗效最好,具有最长的OS,但每个亚型(SCL...
肿瘤免疫亚型纯生信分析套路 膀胱癌(BLCA)是一种复杂的疾病,发病率和死亡率都很高,全球每年至少诊断出43万例。尽管BLCA的治疗取得了较大的进展,但异质性仍是导致其预后不良和复发的主要原因。肿瘤细胞的分子和遗传特性决定了其对治疗的侵袭性和敏感性。因此,将分子亚型整合到BLCA的临床治疗中至关重要。尽管基于基因...
单一测定总的低密度脂蛋白含量并不能显示患心血管疾病的风险,因为它不能区分“大的”和“小而密的”低密度脂蛋白,即使总的低密度脂蛋白水平显示正常,其中的“小而密的”低密度脂蛋白可以使患心血管疾病的风险达到3倍以上。因此,血脂蛋白的细分类...
首先,我们来分析高危型HPV的流行特征。这些亚型通常在性接触过程中传播,尤其是不使用安全措施的性行为。宫颈癌是高危型HPV感染的最常见并且严重的后果之一,但并非每个感染了高危型HPV的人都会发展成宫颈癌。研究表明,感染高危型HPV亚型的女性中,持续感染、长期感染以及多亚型混合感染会增加宫颈癌发生的风险。此外,亚型...
根据病毒基因组中HPV L1区域的序列差异,研究发现存在至少37种不同的HPV亚型。本文将对这些不同亚型的流行特点进行分析。 首先,我们来探讨高风险HPV亚型,即与人类癌症发生风险增加相关的亚型。高风险HPV亚型主要包括HPV16、HPV18、HPV31、HPV33和HPV45。这些亚型在各种HPV相关癌症中具有高度的致病性和传染性。尤其是HPV16...
构建CNV驱动增强子与lncRNA和mRNA之间的亚型特异性调控 为了研究 CNA 驱动的增强子对四种乳腺癌亚型中靶基因表达的影响,本研究首先分别在 Basallike、Her2、LumA、LumB 亚型中鉴定了亚型特异性差异表达基因 (DEG) 和差异表达的 lncRNA (DEL)(图 2A、B)。亚型之间的比较分析表明,Basal-like亚型表现出明显独特的基因...
为科研实验保驾护航。优品生物小鼠单克隆抗体 IgG 四亚型鉴定试剂盒凭借前沿技术、便捷操作、广泛应用和可靠品质，打破传统鉴定方法的局限，为科研工作者开启了高效、精准、便捷的亚型分析新体验。选择优品生物，就是选择更优质的科研工具，让科研之路更加顺畅，助力生命科学领域不断探索创新。
在进行该分析之前,小云为小伙伴简单介绍一下需要注意的要点,第一点首先对肿瘤样本进行分型,第二点准备好免疫检查点基因,最后利用ggpubr包进行亚型间免疫检查点基因表达矩阵显著差异分析,筛选出在不同亚型间有显著差异的免疫检查点基因,这就是大概的分析步骤,下面和小云一起开始今天的实操吧! 准备需要的R包 #安装需...
中国流行的麻疹病毒基因型和亚型趋势分析 麻疹病毒作为传染性极强的病原体，其基因型分布和变异规律直接影响防控效果。我国自1965年推行计划免疫以来，本土麻疹病毒基因型呈现明显演变轨迹。当前监测数据显示，H1基因型仍占据主导地位，但亚型构成和地理分布正发生微妙变化。全球已鉴定的24个麻疹病毒基因型中，我国本土流行...