(1)互作转录组要求取样更精确,应精准取到互作部位 (2)互作转录组建库方法根据互作物种的不同而相应变化,可能会同时剔除真核和原核生物的rRNA;常规转录组只有单一物种,分别使用真核和原核的建库方法。 (3)互作转录组因包含两个物种,需在常规转录组的基础上增大测序量,尽可能的测到互作样本中占比较小的物种。 (4)得
二、互作转录组测序方案设计互作转录组实验基本设计思路是互作样本中的物种与各自物种的对照样本进行差异比较。互作转录组标准的样本构成为两个物种的对照样本以及互作样本。与常规转录组不同的是互作转录组对互作样本中的两个物种同时取样、提取RNA、建库、上机测序。最后获取两个物种RNA的测序结果并分别与这两个物种的...
一、互作转录组在农业中的应用方向 互作转录组通过同时解析植物、动物宿主与特定微生物的动态基因表达网络,科研人员能够精准挖掘宿主抗病基因、揭示微生物致病机制,甚至发现共生微生物提升宿主抗逆性与产量的分子奥秘。这一技术不仅为农业病虫害防治提供了新靶点,更为培育高产优质新品种、构建绿色生态农业模式注入了创新活力,...
1、动植物病虫害防治:研究动植物与病原菌、害虫之间的互作转录组,挖掘动植物的抗病虫基因以及病原菌、害虫的致病、致害基因,为培育抗病虫动植物品种提供靶点,也可为开发新型生物防治手段提供理论支持。 2、生物共生关系研究:对于共生生物,如地衣中的真菌与藻类、豆科植物与根瘤菌等,互作转录组可揭示它们在共生过程中...
互作转录组常用数据库介绍 技术标签: 数据库互作转录组可研究两个物种或多个物种的相互作用机制,也就是说利用该研究方法,我们不仅可以得到宿主防御病原菌机制,也可以研究病原菌如何侵染宿主。关于病原菌如何导致宿主患病和宿主如何防御病原菌入侵,一直以来就是生物学研究的重要内容,因此在很长的研究历程中,就有了...
互作转录组的最大特点便是能够揭示基因之间的交互网络。这就需要利用一些生物信息学工具,如GeneOntology(GO)分析、KEGG通路分析等,来探究基因功能以及通路的变化。这些工具不仅能帮助我们找出潜在的调控基因还能够揭示不同基因在特定生物学过程中可能扮演的角色。 更进一步基因组学与系统生物学得深度融合,互作转录组的...
Highlights1、本文汇总了互作转录组常见实验设计、解读了相关文章思路;2、在农业领域,宿主与微生物的互作转录组研究正成为破解作物抗逆、畜禽健康和水产病害的关键技术;3、派森诺提供宿主-微生物互作转录组服务,助力互作研究,项目经验丰富。之前通过国自然热点 | 宿主-微生物相互作用——互作转录组测序详解这篇软文给大家...
互作转录组可以帮助我们研究物种之间的寄生、感染、共生等互作用关系,只需构建一个文库就可以对多个互作的物种进行表达量的研究。 通过前两次的介绍,相信大家已经有了较清楚的了解,如果忘记了可以复习一下: 你值得拥有的 互作转录组测序 靠转录组测序发文章?不不不,...
本研究从转录水平初步阐明重金属镉胁迫下ZM05和ZM06降解DPrP的互作机制，为重金属污染下微生物组合提高有机污染物降解效率提供了初步的认识。Acinetobacter tandoii ZM06协助Glutamicibacter nicotianae ZM05 抵抗镉压力以维持邻苯二甲酸二丙酯生物降解 Acinetobacter tandoii ZM06 Assists Glutamicibacter nicotianae ZM05 ...
互作转录组,无需分离两物种,避免分离造成的干扰,只构建一个转录组文库便可得到两物种的信息。同时,还可以通过互作模型图获得物种间基因的调控关系,得到两物种间的相互作用机制。 技术流程 分析内容 应用领域 原核转录组项目文章 Zhu P, Idnurm A. The contribution of the White Collar complex to Cryptococcus ...