下载链接:https://pan.baidu.com/s/1Z1LzWfrb_cqtzUsxUbUY4Q?pwd=kay5, 视频播放量 897、弹幕量 1、点赞数 59、投硬币枚数 86、收藏人数 54、转发人数 2, 视频作者 海绵宝宝软件, 作者简介 ,相关视频:Origin 2024b 最新 【专业版-中英双语】批量永久授权激活 激活密钥许
1、拿到数据之后首先需要进行数据的质控,去除低质量,接头等对数据没有用的信息,可以使用Trimmomatic/fas...
Fastp是一个高通量数据质控软件,用于质量控制和修剪测序数据。关于该软件的使用报道很多,以下是其常见的安装和使用方法: 步骤1: 首先,需要安装Fastp软件。可以使用以下命令通过conda进行安装: conda install -c bioconda fastp 步骤2: 运行Fastp 运行Fastp需要提供输入文件的路径、输出文件的路径和其他可选参数。 fastp ...
De Novo组装算法顾问:通过互动式测验帮助用户选择适合其数据的算法。 云个人工作空间:通过Geneious Prime中的安'全个人数据存储,实现在多台计算机上访问数据。 Geneious云数据库:目前仅向拥有个人订阅的学术用户提供。 导出长度图数据:快速简便地将序列长度分布数据导出为csv文件。 对STAR RNA-Seq比对器的改进:现在可以...
二代测序数据分析软件包大全 Integratedsolutions *CLCbio Genomics Workbench-de novoand reference assembly of Sanger, Roche FLX, Illumina, Helicos, and SOLiD data. Commercial next-gen-seq software that extends the CLCbio Main Workbench software. Includes SNP detection, CHiP-seq, browser and other ...
数据产出统计是整个分析流程的基础,通过统计测序产出的数据量,能够评估测序质量。在数据去杂阶段,会使用SeqPrep和Sickle等工具去除低质量读段和接头序列。转录组拼接则需要用到Trinity软件,该软件可以将短读段拼接成连续的转录本,为后续分析奠定基础。在SNP分析阶段,bowtie和RSEM工具将被用于比对和表达量...
二、二代测序宏基因组分析流程 二代宏基因组分析流程图 1、数据质控:使用 kneaddata 软件,该软件先调用 Trimmomatic 过滤数据,然后利用bowtie2 或 bmtagger 比对宿主数据库去除宿主数据 (也可以去除核糖体数据)。 2、如果不拼接,则可以进行物种分类鉴定,包括组成件鉴定和功能鉴定,物种丰度分析,使用软件 MetaPhlAn2 或...
全外显子二代测序数据CNV分析软件是由济南爱新卓尔医学检验有限公司著作的软件著作,该软件著作登记号为:2022SR1603291,属于分类,想要查询更多关于全外显子二代测序数据CNV分析软件著作的著作权信息就到天眼查官网!
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不同的测序项目,数据分析流程及用到的软件有些差异,以转录组测序为例,项目分析流程为:数据产出统计-数据去杂-转录组拼接-SSR分析及SNP分析-基因功能注释-基因表达差异分析-差异基因表达模式聚类-差异基因富集分析。用到的软件有SeqPrep、Sickle、Trinity、bowtie、RSEM、edgeR、BLAST、blast2go、blastx/blastp 2.2.24...