二代测序数据分析平台imp对共享内存缓冲区执行写入或读出序列比对记录时,首先计算出序列比对记录所属的区域块,然后进入该区域块,根据该区域块的本地哈希表的键值,查找到该键值对应的缓冲区地址查找到相应的比对记录,保证每个区域块的数据总量不超过一个节点处理器的内存资源,以避免imp进程在对区域块进行操作时进行qpi内...
CNV注释解读部分除了DGV、DECIPHER数据库外,还提供了基于文本挖掘的CNVision数据库注释。直观的Web操作界面方便了用户的使用和科学研究。结果经过2287例数据测试,创建的无创产前云平台可以对Illumina和Life测序平台的数据以50-100倍的速度进行染色体非整倍体分析,并提供CNV的注释和解读。结论该Web服务(nipt.gtxlab.com)...
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目前二代测序数据分析软件很多,但是绝大多数软件仅能完成单一的分析功能(例如:仅进行序列比对或变异读取或功能注释等),如何能正确高效地选择整合这些软件已成为迫切需求。文章设计了一套基于 perl 语言和 SGE资源管理的自动化处理流程来分析Illumina平台基因组... 查看全部>> ...
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